Advertisement
Research Article

The Carbon Assimilation Network in Escherichia coli Is Densely Connected and Largely Sign-Determined by Directions of Metabolic Fluxes

  • Valentina Baldazzi,

    Affiliation: Institut National de Recherche en Informatique et en Automatique, INRIA Grenoble - Rhône-Alpes, Montbonnot, France

    X
  • Delphine Ropers,

    Affiliation: Institut National de Recherche en Informatique et en Automatique, INRIA Grenoble - Rhône-Alpes, Montbonnot, France

    X
  • Yves Markowicz,

    Affiliations: Institut National de Recherche en Informatique et en Automatique, INRIA Grenoble - Rhône-Alpes, Montbonnot, France, Laboratoire Adaptation et Pathogénie des Microorganismes (CNRS UMR 5163), Université Joseph Fourier, Bâtiment Jean Roget, Faculté de Médecine-Pharmacie, La Tronche, France

    X
  • Daniel Kahn,

    Affiliations: Institut National de Recherche en Informatique et en Automatique, INRIA Grenoble - Rhône-Alpes, Montbonnot, France, Laboratoire de Biométrie et Biologie Evolutive (CNRS UMR 5558), Université Lyon 1, INRA, Villeurbanne, France

    X
  • Johannes Geiselmann,

    Affiliations: Institut National de Recherche en Informatique et en Automatique, INRIA Grenoble - Rhône-Alpes, Montbonnot, France, Laboratoire Adaptation et Pathogénie des Microorganismes (CNRS UMR 5163), Université Joseph Fourier, Bâtiment Jean Roget, Faculté de Médecine-Pharmacie, La Tronche, France

    X
  • Hidde de Jong mail

    Hidde.de-Jong@inria.fr

    Affiliation: Institut National de Recherche en Informatique et en Automatique, INRIA Grenoble - Rhône-Alpes, Montbonnot, France

    X
  • Published: June 10, 2010
  • DOI: 10.1371/journal.pcbi.1000812

About the Authors

Valentina Baldazzi, Delphine Ropers, Yves Markowicz, Daniel Kahn, Johannes Geiselmann, Hidde de Jong
Institut National de Recherche en Informatique et en Automatique, INRIA Grenoble - Rhône-Alpes, Montbonnot, France
Yves Markowicz, Johannes Geiselmann
Laboratoire Adaptation et Pathogénie des Microorganismes (CNRS UMR 5163), Université Joseph Fourier, Bâtiment Jean Roget, Faculté de Médecine-Pharmacie, La Tronche, France
Daniel Kahn
Laboratoire de Biométrie et Biologie Evolutive (CNRS UMR 5558), Université Lyon 1, INRA, Villeurbanne, France

Corresponding Author

Email: Hidde.de-Jong@inria.fr

Competing Interests

The authors have declared that no competing interests exist.

Author Contributions

Conceived and designed the experiments: VB HdJ. Performed the experiments: VB. Analyzed the data: VB DR YM DK JG HdJ. Wrote the paper: VB DR DK JG HdJ. Designed the model: DR YM JG.