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Research Article

pH-Dependent Conformational Changes in Proteins and Their Effect on Experimental pKas: The Case of Nitrophorin 4

  • Natali V. Di Russo,

    Affiliations: Quantum Theory Project and Department of Chemistry, University of Florida, Gainesville, Florida, United States of America, Departamento de Química Inorgánica, Analítica y Química Física/INQUIMAE-CONICET, Facultad de Ciencias Exactas y Naturales, Universidad de Buenos Aires, Ciudad Universitaria, Buenos Aires, Argentina

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  • Dario A. Estrin,

    Affiliation: Departamento de Química Inorgánica, Analítica y Química Física/INQUIMAE-CONICET, Facultad de Ciencias Exactas y Naturales, Universidad de Buenos Aires, Ciudad Universitaria, Buenos Aires, Argentina

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  • Marcelo A. Martí mail,

    marcelo@qi.fcen.uba.ar (MAM); roitberg@ufl.edu (AER)

    Affiliations: Departamento de Química Inorgánica, Analítica y Química Física/INQUIMAE-CONICET, Facultad de Ciencias Exactas y Naturales, Universidad de Buenos Aires, Ciudad Universitaria, Buenos Aires, Argentina, Departamento de Química Biológica, Facultad de Ciencias Exactas y Naturales, Universidad de Buenos Aires, Ciudad Universitaria, Buenos Aires, Argentina

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  • Adrian E. Roitberg mail

    marcelo@qi.fcen.uba.ar (MAM); roitberg@ufl.edu (AER)

    Affiliation: Quantum Theory Project and Department of Chemistry, University of Florida, Gainesville, Florida, United States of America

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  • Published: November 01, 2012
  • DOI: 10.1371/journal.pcbi.1002761

About the Authors

Natali V. Di Russo, Adrian E. Roitberg
Quantum Theory Project and Department of Chemistry, University of Florida, Gainesville, Florida, United States of America
Natali V. Di Russo, Dario A. Estrin, Marcelo A. Martí
Departamento de Química Inorgánica, Analítica y Química Física/INQUIMAE-CONICET, Facultad de Ciencias Exactas y Naturales, Universidad de Buenos Aires, Ciudad Universitaria, Buenos Aires, Argentina
Marcelo A. Martí
Departamento de Química Biológica, Facultad de Ciencias Exactas y Naturales, Universidad de Buenos Aires, Ciudad Universitaria, Buenos Aires, Argentina

Corresponding Authors

Competing Interests

The authors have declared that no competing interests exist.

Author Contributions

Conceived and designed the experiments: DAE MAM AER. Performed the experiments: NVDR. Analyzed the data: NVDR MAM AER. Contributed reagents/materials/analysis tools: DAE MAM AER. Wrote the paper: NVDR DAE MAM AER.