==> AP-2alpha_Snyder_HeLa-S3.gem.pfm <== DE AP-2alpha_Snyder 0 47 726 684 104 S 1 0 1560 0 0 C 2 0 1560 0 0 C 3 0 149 26 1386 T 4 0 170 1391 0 G 5 537 94 930 0 R 6 0 0 1560 0 G 7 0 0 1560 0 G 8 110 811 541 99 S XX DE AP-2alpha_Snyder_v2 0 0 0 0 641 T 1 0 0 641 0 G 2 0 641 0 0 C 3 0 641 0 0 C 4 0 641 0 0 C 5 0 0 0 641 T XX DE AP-2alpha_Snyder_v3 0 0 0 0 347 T 1 0 0 347 0 G 2 313 34 0 0 A 3 0 0 347 0 G 4 0 0 0 347 T 5 0 347 0 0 C 6 347 0 0 0 A XX DE AP-2alpha_Snyder_v4 0 1 337 1 1 C 1 1 337 1 1 C 2 106 232 1 1 C 3 337 1 1 1 A 4 1 1 337 1 G 5 1 1 337 1 G 6 1 1 337 1 G XX ==> AP-2gamma_Snyder_HeLa-S3.gem.pfm <== DE AP-2gamma_Snyder 0 109 579 853 128 S 1 0 1669 0 0 C 2 0 1669 0 0 C 3 0 1065 134 471 C 4 0 1515 155 0 C 5 1378 35 171 86 A 6 0 0 1669 0 G 7 0 0 1669 0 G 8 138 715 744 73 S XX DE AP-2gamma_Snyder_v2 0 0 0 0 370 T 1 0 0 370 0 G 2 337 33 0 0 A 3 0 0 370 0 G 4 0 0 0 370 T 5 0 370 0 0 C 6 370 0 0 0 A XX DE AP-2gamma_Snyder_v3 0 0 317 0 0 C 1 271 0 47 0 A 2 0 0 317 0 G 3 0 0 317 0 G 4 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DE CEBPB_Snyder_Hep_v5 0 10 2 25 383 T 1 2 2 414 2 G 2 155 2 2 261 T 3 2 414 2 2 C 4 414 2 2 2 A 5 2 414 2 2 C 6 414 2 2 2 A XX DE CEBPB_Snyder_Hep_v6 0 3 3 279 3 G 1 3 3 3 279 T 2 3 3 279 3 G 3 3 279 3 3 C 4 279 3 3 3 A 5 3 3 279 3 G 6 3 3 3 279 T XX ==> c-Fos_Snyder_HeLa-S3.gem.pfm <== DE c-Fos_Snyder_HeL 0 0 10 0 2703 T 1 0 0 2504 209 G 2 2692 21 0 0 A 3 0 0 2456 258 G 4 0 0 0 2713 T 5 87 2626 0 0 C 6 2713 0 0 0 A XX DE c-Fos_Snyder_HeL_v2 0 173 0 125 0 R 1 0 298 0 0 C 2 298 0 0 0 A 3 0 0 0 298 T 4 0 0 0 298 T 5 0 298 0 0 C 6 0 298 0 0 C XX ==> c-Jun_Snyder_GM12878.gem.pfm <== DE c-Jun_Snyder_GM1 0 0 0 0 1877 T 1 0 0 1653 224 G 2 1877 0 0 0 A 3 180 1697 0 0 C 4 0 0 0 1877 T 5 194 1683 0 0 C 6 1877 0 0 0 A XX DE c-Jun_Snyder_GM1_v2 0 555 1 1 1 A 1 1 241 315 1 S 2 1 1 1 555 T 3 1 1 1 555 T 4 1 1 1 555 T 5 1 555 1 1 C 6 555 1 1 1 A XX DE c-Jun_Snyder_GM1_v3 0 1033 0 0 0 A 1 0 702 331 0 C 2 0 32 0 1001 T 3 0 70 963 0 G 4 1033 0 0 0 A 5 859 0 175 0 A 6 1033 0 0 0 A XX DE c-Jun_Snyder_GM1_v4 0 0 0 372 0 G 1 0 0 0 372 T 2 0 0 372 0 G 3 0 0 372 0 G 4 0 0 0 372 T 5 0 0 0 372 T 6 121 0 0 251 T XX DE c-Jun_Snyder_GM1_v5 0 0 207 0 90 C 1 297 0 0 0 A 2 0 0 297 0 G 3 0 0 0 297 T 4 0 297 0 0 C 5 297 0 0 0 A 6 0 0 0 297 T XX DE c-Jun_Snyder_GM1_v6 0 0 0 293 0 G 1 293 0 0 0 A 2 293 0 0 0 A 3 293 0 0 0 A 4 0 0 0 293 T 5 0 0 293 0 G 6 293 0 0 0 A XX DE c-Jun_Snyder_GM1_v7 0 233 14 58 24 A 1 1 1 328 1 G 2 1 1 328 1 G 3 328 1 1 1 A 4 328 1 1 1 A 5 1 1 328 1 G 6 1 1 1 328 T XX ==> c-Jun_Snyder_HeLa-S3.gem.pfm <== DE c-Jun_Snyder_HeL 0 0 11 0 2822 T 1 0 0 2663 170 G 2 2747 24 0 62 A 3 343 0 2491 0 G 4 0 0 0 2833 T 5 120 2714 0 0 C 6 2833 0 0 0 A XX DE c-Jun_Snyder_HeL_v2 0 222 2 543 38 G 1 1 1 803 1 G 2 803 1 1 1 A 3 803 1 1 1 A 4 1 1 1 803 T 5 1 1 803 1 G XX DE c-Jun_Snyder_HeL_v3 0 170 1 145 1 R 1 314 1 1 1 A 2 1 1 1 314 T 3 1 1 314 1 G 4 314 1 1 1 A 5 1 314 1 1 C 6 1 1 35 280 T XX DE c-Jun_Snyder_HeL_v4 0 0 0 0 386 T 1 0 0 360 26 G 2 386 0 0 0 A 3 0 257 0 129 C 4 133 0 253 0 G 5 18 350 0 19 C 6 386 0 0 0 A XX ==> c-Jun_Snyder_HUVEC.gem.pfm <== DE c-Jun_Snyder_HUV 0 0 0 0 2832 T 1 0 37 2669 126 G 2 2832 0 0 0 A 3 0 2489 0 343 C 4 0 0 43 2789 T 5 216 2617 0 0 C 6 2821 0 12 0 A XX DE c-Jun_Snyder_HUV_v2 0 900 0 0 0 A 1 0 314 0 586 T 2 0 0 0 900 T 3 0 0 0 900 T 4 0 900 0 0 C 5 0 900 0 0 C 6 0 0 0 900 T XX DE c-Jun_Snyder_HUV_v3 0 0 0 0 417 T 1 0 0 417 0 G 2 417 0 0 0 A 3 0 82 0 335 T 4 0 0 417 0 G 5 99 0 0 318 T 6 0 417 0 0 C XX DE c-Jun_Snyder_HUV_v4 0 0 487 0 252 C 1 179 0 0 560 T 2 0 0 0 739 T 3 0 739 0 0 C 4 0 739 0 0 C 5 0 0 18 721 T 6 0 0 739 0 G XX DE c-Jun_Snyder_HUV_v5 0 263 0 0 0 A 1 0 136 128 0 S 2 263 0 0 0 A 3 263 0 0 0 A 4 0 0 0 263 T 5 0 0 263 0 G 6 263 0 0 0 A XX ==> c-Jun_Snyder_K562.gem.pfm <== DE c-Jun_Snyder_K56 0 0 4 0 1897 T 1 0 0 1850 50 G 2 1849 24 0 28 A 3 71 415 1398 17 G 4 0 0 0 1900 T 5 0 1900 0 0 C 6 1900 0 0 0 A 7 13 360 160 1368 T XX DE c-Jun_Snyder_K56_v2 0 0 0 0 624 T 1 0 0 583 41 G 2 589 0 0 35 A 3 0 624 0 0 C 4 290 192 143 0 N 5 0 0 0 624 T 6 0 624 0 0 C 7 600 0 0 24 A XX DE c-Jun_Snyder_K56_v3 0 1 394 29 1 C 1 1 38 1 384 T 2 1 1 1 422 T 3 422 1 1 1 A 4 1 1 1 422 T 5 1 422 1 1 C 6 42 1 1 381 T XX DE c-Jun_Snyder_K56_v4 0 11 64 185 4 G 1 10 83 1 169 T 2 1 261 1 1 C 3 261 1 1 1 A 4 1 261 1 1 C 5 1 57 206 1 G 6 5 7 3 248 T 7 4 19 227 13 G XX ==> c-Jun_Snyder_K562-IFNa6h.gem.pfm <== DE c-Jun_Snyder_K56 0 0 0 0 2574 T 1 0 0 2551 23 G 2 2574 0 0 0 A 3 77 1258 1227 12 S 4 0 0 8 2566 T 5 42 2532 0 0 C 6 2569 0 5 0 A 7 34 364 213 1965 T XX DE c-Jun_Snyder_K56_v2 0 733 30 32 312 A 1 5 1 1100 1 G 2 1106 0 0 0 A 3 0 0 0 1106 T 4 1106 0 0 0 A 5 1106 0 0 0 A 6 228 70 742 67 G XX DE c-Jun_Snyder_K56_v3 0 327 105 192 18 R 1 0 0 0 641 T 2 0 0 601 40 G 3 614 0 0 27 A 4 0 641 0 0 C 5 271 190 133 47 N 6 0 0 0 641 T 7 0 641 0 0 C 8 641 0 0 0 A XX ==> c-Jun_Snyder_K562-IFNg30.gem.pfm <== DE c-Jun_Snyder_K56 0 0 0 0 2120 T 1 6 0 2063 52 G 2 2083 11 0 27 A 3 84 462 1549 26 G 4 0 0 0 2120 T 5 22 2098 0 0 C 6 2120 0 0 0 A 7 17 319 165 1621 T XX DE c-Jun_Snyder_K56_v2 0 578 12 1 73 A 1 1 1 662 1 G 2 662 1 1 1 A 3 1 1 1 662 T 4 628 1 1 35 A 5 662 1 1 1 A 6 65 1 551 48 G 7 154 94 377 40 N XX DE c-Jun_Snyder_K56_v3 0 0 0 0 583 T 1 0 0 583 0 G 2 583 0 0 0 A 3 57 85 183 258 N 4 0 0 583 0 G 5 29 0 0 554 T 6 31 552 0 0 C 7 583 0 0 0 A XX DE c-Jun_Snyder_K56_v4 0 2 2 293 2 G 1 2 2 2 293 T 2 2 2 293 2 G 3 2 2 293 2 G 4 2 2 293 2 G 5 133 2 2 162 W 6 2 2 293 2 G XX ==> c-Jun_Snyder_K562-IFNg6h.gem.pfm <== DE c-Jun_Snyder_K56 0 10 0 0 2507 T 1 0 0 2447 71 G 2 2485 12 0 21 A 3 95 510 1887 26 G 4 0 0 0 2517 T 5 37 2480 0 0 C 6 2517 0 0 0 A 7 15 346 150 2007 T XX DE c-Jun_Snyder_K56_v2 0 0 0 0 676 T 1 0 0 676 0 G 2 676 0 0 0 A 3 45 92 193 347 N 4 0 78 598 0 G 5 0 0 0 676 T 6 56 620 0 0 C 7 676 0 0 0 A XX DE c-Jun_Snyder_K56_v3 0 499 15 1 94 A 1 1 1 607 1 G 2 607 1 1 1 A 3 1 1 1 607 T 4 607 1 1 1 A 5 570 1 38 1 A 6 1 81 527 1 G 7 378 99 131 1 A XX ==> c-Myc_Crawford_GM12878.gem.pfm <== DE c-Myc_Crawford_G 0 0 1136 0 0 C 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c-Myc_Crawford_MCF-7-vehicle.gem.pfm <== DE c-Myc_Crawford_M 0 0 556 0 0 C 1 556 0 0 0 A 2 0 556 0 0 C 3 0 0 556 0 G 4 110 205 0 242 Y 5 0 0 556 0 G XX DE c-Myc_Crawford_M_v2 0 0 487 0 0 C 1 0 0 487 0 G 2 35 0 0 452 T 3 0 314 173 0 C 4 122 0 365 0 G 5 0 487 0 0 C XX DE c-Myc_Crawford_M_v3 0 0 325 0 0 C 1 0 0 325 0 G 2 0 325 0 0 C 3 0 0 0 325 T 4 0 0 325 0 G 5 0 325 0 0 C XX DE c-Myc_Crawford_M_v4 0 113 0 187 0 G 1 0 300 0 0 C 2 300 0 0 0 A 3 0 300 0 0 C 4 0 0 300 0 G 5 0 300 0 0 C XX ==> c-Myc_Snyder_GM12878.gem.pfm <== DE c-Myc_Snyder_GM1 0 0 1735 0 0 C 1 1516 0 219 0 A 2 0 970 0 765 Y 3 0 0 1735 0 G 4 168 0 0 1567 T 5 0 0 1735 0 G XX DE c-Myc_Snyder_GM1_v2 0 0 0 423 0 G 1 0 0 0 423 T 2 0 0 423 0 G 3 0 0 423 0 G 4 0 0 0 423 T 5 0 0 0 423 T XX ==> c-Myc_Snyder_HeLa-S3.gem.pfm <== DE c-Myc_Snyder_HeL 0 0 545 0 0 C 1 373 0 172 0 A 2 0 545 0 0 C 3 0 0 545 0 G 4 99 0 0 446 T 5 0 0 545 0 G XX DE c-Myc_Snyder_HeL_v2 0 79 44 118 432 T 1 0 0 672 0 G 2 540 133 0 0 A 3 0 64 608 0 G 4 0 0 0 672 T 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c-Myc_Snyder_K56_v4 0 0 275 0 0 C 1 0 275 0 0 C 2 0 0 275 0 G 3 0 0 275 0 G 4 275 0 0 0 A 5 275 0 0 0 A XX ==> c-Myc_Snyder_K562-IFNg6h.gem.pfm <== DE c-Myc_Snyder_K56 0 0 1407 0 0 C 1 1215 0 0 192 A 2 0 1407 0 0 C 3 441 0 966 0 G 4 0 236 0 1171 T 5 0 0 1407 0 G XX DE c-Myc_Snyder_K56_v2 0 217 14 23 89 A 1 0 0 342 0 G 2 342 0 0 0 A 3 0 0 0 342 T 4 342 0 0 0 A 5 342 0 0 0 A 6 0 0 342 0 G XX DE c-Myc_Snyder_K56_v3 0 0 0 273 0 G 1 0 185 0 88 C 2 0 273 0 0 C 3 273 0 0 0 A 4 0 273 0 0 C 5 0 0 273 0 G XX ==> CTCF_Bernstein_GM12878.gem.pfm <== DE CTCF_Bernstein_G 0 60 1600 48 44 C 1 1187 113 237 215 A 2 120 931 610 92 S 3 216 819 167 549 N 4 1577 15 70 90 A 5 0 0 1751 0 G 6 772 0 979 0 R 7 0 0 1077 675 G 8 0 0 1751 0 G 9 0 0 1751 0 G 10 9 1724 2 16 C 11 959 70 629 94 R XX DE CTCF_Bernstein_G_v2 0 29 993 29 0 C 1 0 1050 0 0 C 2 844 69 20 118 A 3 0 982 68 0 C 4 106 254 0 690 T 5 1050 0 0 0 A 6 0 0 1050 0 G 7 320 126 535 69 R 8 137 95 512 307 N 9 80 102 793 76 G XX DE CTCF_Bernstein_G_v3 0 18 19 566 13 G 1 0 79 536 0 G 2 0 615 0 0 C 3 0 0 615 0 G 4 0 615 0 0 C 5 27 127 26 437 T XX DE CTCF_Bernstein_G_v4 0 1 1 1 287 T 1 1 1 287 1 G 2 1 1 287 1 G 3 1 1 1 287 T 4 1 1 287 1 G 5 1 287 1 1 C 6 1 123 1 165 Y XX DE CTCF_Bernstein_G_v5 0 0 167 274 0 G 1 0 441 0 0 C 2 441 0 0 0 A 3 0 0 441 0 G 4 0 441 0 0 C 5 441 0 0 0 A 6 0 89 353 0 G XX DE CTCF_Bernstein_G_v6 0 92 1 286 1 G 1 1 377 1 1 C 2 377 1 1 1 A 3 1 377 1 1 C 4 1 1 1 377 T 5 55 1 323 1 G 6 1 286 1 91 C XX ==> CTCF_Bernstein_H1-hESC.gem.pfm <== DE CTCF_Bernstein_H 0 81 522 66 685 Y 1 0 0 1353 0 G 2 0 1353 0 0 C 3 0 1353 0 0 C 4 443 910 0 0 C 5 0 790 0 563 Y 6 0 1353 0 0 C 7 22 16 9 1306 T 8 342 173 682 156 N 9 74 509 654 118 S 10 206 200 102 846 T 11 34 53 1202 65 G XX DE CTCF_Bernstein_H_v2 0 73 1230 128 71 C 1 24 1434 22 21 C 2 1267 38 38 160 A 3 0 1018 483 0 C 4 104 759 0 639 Y 5 1501 0 0 0 A 6 3 5 1484 10 G 7 365 134 941 62 G 8 236 163 713 390 N 9 134 179 1070 118 G XX DE CTCF_Bernstein_H_v3 0 1 1 717 1 G 1 1 717 1 1 C 2 717 1 1 1 A 3 1 1 717 1 G 4 1 600 1 118 C 5 717 1 1 1 A XX DE CTCF_Bernstein_H_v4 0 286 33 176 42 R 1 4 22 491 20 G 2 0 536 0 0 C 3 0 0 536 0 G 4 0 536 0 0 C 5 7 516 8 5 C 6 106 324 69 38 C 7 28 292 59 158 Y XX DE CTCF_Bernstein_H_v5 0 265 1 1 1 A 1 1 1 265 1 G 2 113 1 154 1 R 3 1 1 265 1 G 4 1 1 1 265 T 5 1 1 265 1 G 6 1 265 1 1 C XX ==> CTCF_Bernstein_HeLa-S3.gem.pfm <== DE CTCF_Bernstein_H 0 51 1084 49 32 C 1 824 82 148 163 A 2 89 608 454 66 S 3 147 603 130 337 N 4 1216 0 0 0 A 5 0 0 1216 0 G 6 733 0 483 0 A 7 0 0 1032 185 G 8 0 26 1190 0 G 9 0 0 1216 0 G 10 0 1216 0 0 C 11 617 81 431 88 R XX DE CTCF_Bernstein_H_v2 0 35 992 19 0 C 1 0 1046 0 0 C 2 837 64 15 131 A 3 0 983 64 0 C 4 100 308 0 638 T 5 1046 0 0 0 A 6 0 0 1046 0 G 7 324 124 527 72 R 8 155 91 489 312 N 9 73 105 777 92 G XX DE CTCF_Bernstein_H_v3 0 1 1 486 1 G 1 1 1 486 1 G 2 1 486 1 1 C 3 486 1 1 1 A 4 1 123 364 1 G 5 1 404 1 83 C 6 486 1 1 1 A XX DE CTCF_Bernstein_H_v4 0 1 1 358 25 G 1 1 382 1 1 C 2 1 1 382 1 G 3 1 382 1 1 C 4 1 382 1 1 C 5 97 227 1 60 M 6 1 325 1 58 C XX DE CTCF_Bernstein_H_v5 0 83 0 216 0 G 1 0 259 0 40 C 2 299 0 0 0 A 3 0 299 0 0 C 4 0 0 0 299 T 5 35 0 264 0 G 6 0 299 0 0 C XX ==> CTCF_Bernstein_HepG2.gem.pfm <== DE CTCF_Bernstein_H 0 104 2476 86 63 C 1 1939 192 308 290 A 2 180 1592 865 93 S 3 229 1376 195 929 Y 4 2546 31 72 80 A 5 4 4 2716 5 G 6 1130 39 1545 16 R 7 93 30 1759 847 G 8 35 42 2626 25 G 9 108 136 2354 131 G XX DE CTCF_Bernstein_H_v2 0 1 1 492 1 G 1 1 492 1 1 C 2 1 1 492 1 G 3 1 492 1 1 C 4 1 492 1 1 C 5 137 292 1 64 M 6 1 393 1 100 C XX DE CTCF_Bernstein_H_v3 0 1 588 1 1 C 1 1 1 1 588 T 2 1 1 588 1 G 3 1 588 1 1 C 4 230 1 1 358 T 5 1 1 588 1 G 6 1 1 588 1 G XX DE CTCF_Bernstein_H_v4 0 1 1 601 151 G 1 1 1 751 1 G 2 1 751 1 1 C 3 751 1 1 1 A 4 1 130 621 1 G 5 1 637 1 115 C 6 751 1 1 1 A XX DE CTCF_Bernstein_H_v5 0 1 459 1 1 C 1 1 1 1 459 T 2 313 1 1 147 A 3 1 1 459 1 G 4 1 38 85 337 T 5 1 1 459 1 G 6 1 46 414 1 G XX DE CTCF_Bernstein_H_v6 0 1 1 402 1 G 1 1 357 1 46 C 2 402 1 1 1 A 3 1 1 402 1 G 4 1 1 1 402 T 5 1 1 334 69 G 6 1 285 1 118 C XX DE CTCF_Bernstein_H_v7 0 9 177 29 102 Y 1 10 282 17 8 C 2 1 1 1 314 T 3 57 1 258 1 G 4 1 1 314 1 G 5 1 314 1 1 C 6 1 1 314 1 G XX ==> CTCF_Bernstein_HMEC.gem.pfm <== DE CTCF_Bernstein_H 0 322 2048 305 287 C 1 89 2719 88 67 C 2 2225 153 289 295 A 3 171 1935 757 99 C 4 312 1301 207 1142 Y 5 2654 40 141 127 A 6 0 0 2961 0 G 7 1325 98 1485 54 R 8 106 38 1949 869 G 9 48 54 2823 37 G 10 105 95 2644 117 G XX DE CTCF_Bernstein_H_v2 0 1 1 1059 1 G 1 1 1 1059 1 G 2 1 1059 1 1 C 3 1059 1 1 1 A 4 1 1 1059 1 G 5 1 574 1 486 Y XX DE CTCF_Bernstein_H_v3 0 1 1 974 1 G 1 1 1 974 1 G 2 1 974 1 1 C 3 363 1 611 1 G 4 1 974 1 1 C 5 1 211 1 764 T XX DE CTCF_Bernstein_H_v4 0 0 1284 0 0 C 1 1284 0 0 0 A 2 0 310 974 0 G 3 0 1071 0 213 C 4 1284 0 0 0 A 5 0 0 1284 0 G XX DE CTCF_Bernstein_H_v5 0 1 340 1 1 C 1 1 1 340 1 G 2 1 340 1 1 C 3 1 240 1 100 C 4 340 1 1 1 A 5 1 1 340 1 G XX DE CTCF_Bernstein_H_v6 0 1 306 1 1 C 1 1 1 1 306 T 2 1 1 1 306 T 3 1 1 306 1 G 4 1 1 1 306 T 5 1 1 306 1 G XX ==> CTCF_Bernstein_HSMM.gem.pfm <== DE CTCF_Bernstein_H 0 221 1499 265 240 C 1 0 2225 0 0 C 2 1998 0 45 182 A 3 0 2021 205 0 C 4 294 843 0 1088 Y 5 2225 0 0 0 A 6 0 0 2225 0 G 7 836 242 1061 88 R 8 239 166 1083 737 K 9 146 157 1810 113 G 10 182 254 1534 256 G XX DE CTCF_Bernstein_H_v2 0 45 50 1483 31 G 1 1 1607 1 1 C 2 1607 1 1 1 A 3 1 1 1607 1 G 4 1 1149 1 459 C 5 1326 134 63 85 A XX DE CTCF_Bernstein_H_v3 0 0 0 379 221 G 1 23 0 577 0 G 2 0 0 600 0 G 3 0 600 0 0 C 4 0 0 600 0 G 5 0 600 0 0 C XX DE CTCF_Bernstein_H_v4 0 1 1 488 1 G 1 1 1 488 1 G 2 1 488 1 1 C 3 488 1 1 1 A 4 1 1 488 1 G 5 1 1 1 488 T XX DE CTCF_Bernstein_H_v5 0 1 317 1 1 C 1 1 1 317 1 G 2 1 317 1 1 C 3 1 193 1 124 C 4 317 1 1 1 A 5 1 1 317 1 G XX DE CTCF_Bernstein_H_v6 0 1 255 1 1 C 1 1 1 1 255 T 2 1 1 1 255 T 3 1 1 255 1 G 4 1 1 1 255 T 5 1 1 255 1 G XX ==> CTCF_Bernstein_HUVEC.gem.pfm <== DE CTCF_Bernstein_H 0 73 2117 66 38 C 1 1606 165 296 226 A 2 127 1334 750 82 S 3 207 1090 168 827 Y 4 2135 20 64 74 A 5 0 0 2292 0 G 6 1021 8 1260 4 R 7 31 8 1523 731 G 8 25 17 2241 10 G 9 53 70 2089 80 G 10 228 1860 65 140 C 11 1079 132 963 119 R XX DE CTCF_Bernstein_H_v2 0 1 607 1 1 C 1 1 1 95 513 T 2 131 1 219 259 N 3 1 1 607 1 G 4 1 1 1 607 T 5 1 1 607 1 G 6 1 1 607 1 G XX DE CTCF_Bernstein_H_v3 0 51 0 510 0 G 1 76 111 275 100 N 2 35 0 526 0 G 3 0 0 561 0 G 4 0 561 0 0 C 5 0 0 561 0 G 6 0 561 0 0 C XX DE CTCF_Bernstein_H_v4 0 1 510 1 1 C 1 1 69 1 442 T 2 1 1 510 1 G 3 1 510 1 1 C 4 207 1 1 304 W 5 1 1 510 1 G 6 1 1 510 1 G XX DE CTCF_Bernstein_H_v5 0 1 283 1 1 C 1 1 1 64 220 T 2 159 125 1 1 M 3 1 1 283 1 G 4 283 1 1 1 A 5 1 1 283 1 G 6 1 1 283 1 G XX DE CTCF_Bernstein_H_v6 0 74 0 253 0 G 1 0 268 0 59 C 2 327 0 0 0 A 3 0 327 0 0 C 4 0 0 0 327 T 5 47 0 280 0 G 6 0 327 0 0 C XX DE CTCF_Bernstein_H_v7 0 0 0 311 0 G 1 0 0 311 0 G 2 0 311 0 0 C 3 311 0 0 0 A 4 0 81 230 0 G 5 0 311 0 0 C 6 311 0 0 0 A XX DE CTCF_Bernstein_H_v8 0 1 1 251 1 G 1 1 1 251 1 G 2 1 251 1 1 C 3 1 251 1 1 C 4 122 1 130 1 R 5 1 251 1 1 C 6 1 1 1 251 T XX ==> CTCF_Bernstein_K562.gem.pfm <== DE CTCF_Bernstein_K 0 48 873 53 31 C 1 630 75 147 151 A 2 78 485 383 57 S 3 104 558 124 218 N 4 1003 0 0 0 A 5 0 0 1003 0 G 6 324 0 679 0 G 7 0 0 740 264 G 8 0 30 974 0 G 9 0 0 1003 0 G 10 0 1003 0 0 C 11 455 62 416 71 R XX DE CTCF_Bernstein_K_v2 0 56 576 102 71 C 1 226 371 97 111 N 2 60 408 105 232 N 3 0 804 0 0 C 4 0 0 0 804 T 5 470 0 242 93 R 6 34 52 718 0 G 7 93 20 61 631 T 8 0 0 804 0 G 9 0 0 804 0 G XX DE CTCF_Bernstein_K_v3 0 0 0 352 0 G 1 0 0 352 0 G 2 0 352 0 0 C 3 286 0 66 0 A 4 0 0 352 0 G 5 0 289 0 63 C 6 352 0 0 0 A XX DE CTCF_Bernstein_K_v4 0 0 0 353 0 G 1 0 353 0 0 C 2 0 0 353 0 G 3 0 353 0 0 C 4 0 312 0 41 C 5 97 256 0 0 C 6 0 285 0 68 C XX DE CTCF_Bernstein_K_v5 0 0 255 0 0 C 1 255 0 0 0 A 2 0 0 255 0 G 3 0 255 0 0 C 4 255 0 0 0 A 5 0 0 255 0 G 6 0 0 255 0 G XX ==> CTCF_Bernstein_NHEK.gem.pfm <== DE CTCF_Bernstein_N 0 204 1232 232 205 C 1 0 1872 0 0 C 2 1675 0 34 163 A 3 0 1682 190 0 C 4 227 740 0 906 Y 5 1872 0 0 0 A 6 0 0 1872 0 G 7 664 227 905 77 R 8 230 144 892 607 K 9 126 160 1485 101 G 10 183 229 1235 225 G XX DE CTCF_Bernstein_N_v2 0 245 4 195 24 R 1 1 1 466 1 G 2 1 466 1 1 C 3 1 1 466 1 G 4 1 466 1 1 C 5 1 466 1 1 C 6 132 335 1 1 C XX DE CTCF_Bernstein_N_v3 0 1 1 1 401 T 1 401 1 1 1 A 2 1 268 134 1 C 3 1 1 1 401 T 4 1 1 401 1 G 5 1 401 1 1 C XX ==> CTCF_Bernstein_NHLF.gem.pfm <== DE CTCF_Bernstein_N 0 57 1235 51 32 C 1 927 88 195 165 A 2 94 697 515 69 S 3 169 679 161 366 N 4 1259 17 54 45 A 5 0 0 1374 0 G 6 815 0 559 0 R 7 0 0 1189 185 G 8 0 0 1374 0 G 9 0 0 1374 0 G 10 0 1374 0 0 C 11 724 56 516 79 R XX DE CTCF_Bernstein_N_v2 0 0 958 36 0 C 1 0 993 0 0 C 2 814 67 20 93 A 3 0 912 55 27 C 4 108 276 0 609 T 5 993 0 0 0 A 6 0 0 993 0 G 7 303 115 508 68 R 8 132 105 470 287 N 9 83 103 734 74 G XX DE CTCF_Bernstein_N_v3 0 1 249 276 1 S 1 1 525 1 1 C 2 525 1 1 1 A 3 1 1 525 1 G 4 1 525 1 1 C 5 525 1 1 1 A 6 1 1 525 1 G XX DE CTCF_Bernstein_N_v4 0 423 1 159 1 A 1 1 1 581 1 G 2 1 581 1 1 C 3 163 1 419 1 G 4 1 581 1 1 C 5 1 581 1 1 C 6 430 152 1 1 A XX DE CTCF_Bernstein_N_v5 0 91 1 441 1 G 1 57 407 1 69 C 2 423 1 109 1 A 3 1 531 1 1 C 4 1 1 1 531 T 5 55 1 477 1 G 6 1 531 1 1 C XX ==> CTCF_Crawford_Gliobla.gem.pfm <== DE CTCF_Crawford_Gl 0 66 1249 74 23 C 1 867 95 232 219 A 2 91 707 534 81 S 3 143 765 166 339 N 4 1322 17 30 44 A 5 1 1 1411 1 G 6 357 1 1055 1 G 7 1 1 1055 357 G 8 1 1 1411 1 G 9 1 1 1411 1 G 10 1 1411 1 1 C 11 731 62 548 71 R XX DE CTCF_Crawford_Gl_v2 0 30 915 19 0 C 1 0 964 0 0 C 2 770 59 28 108 A 3 0 910 55 0 C 4 103 289 0 573 Y 5 964 0 0 0 A 6 0 0 964 0 G 7 311 119 468 67 R 8 142 104 423 297 N 9 61 93 742 69 G XX DE CTCF_Crawford_Gl_v3 0 367 33 178 34 R 1 14 15 562 21 G 2 0 611 0 0 C 3 0 0 611 0 G 4 0 611 0 0 C 5 5 579 17 12 C 6 126 356 92 38 N 7 49 281 105 177 N 8 51 387 113 61 C XX DE CTCF_Crawford_Gl_v4 0 10 5 443 25 G 1 1 1 481 1 G 2 1 481 1 1 C 3 408 1 74 1 A 4 1 1 481 1 G 5 1 398 1 84 C 6 481 1 1 1 A XX DE CTCF_Crawford_Gl_v5 0 74 0 228 0 G 1 0 263 0 39 C 2 302 0 0 0 A 3 0 302 0 0 C 4 0 0 0 302 T 5 42 0 260 0 G 6 0 302 0 0 C XX DE CTCF_Crawford_Gl_v6 0 261 1 1 1 A 1 1 1 261 1 G 2 1 261 1 1 C 3 261 1 1 1 A 4 1 261 1 1 C 5 1 261 1 1 C 6 216 30 4 13 A XX DE CTCF_Crawford_Gl_v7 0 0 0 265 0 G 1 0 48 0 217 T 2 0 14 251 0 G 3 0 0 265 0 G 4 0 265 0 0 C 5 0 227 38 0 C 6 265 0 0 0 A XX ==> CTCF_Crawford_GM12878.gem.pfm <== DE CTCF_Crawford_GM 0 55 1257 62 34 C 1 931 81 222 172 A 2 101 703 524 79 S 3 163 723 157 364 N 4 1406 0 0 0 A 5 0 0 1406 0 G 6 857 0 549 0 A 7 0 11 1181 215 G 8 0 28 1353 25 G 9 0 0 1406 0 G 10 0 1406 0 0 C 11 681 84 559 83 R XX DE CTCF_Crawford_GM_v2 0 32 926 14 0 C 1 0 971 0 0 C 2 776 55 25 116 A 3 0 910 61 0 C 4 102 258 0 612 T 5 971 0 0 0 A 6 0 0 971 0 G 7 302 111 493 66 R 8 136 89 438 310 N 9 64 91 745 72 G XX DE CTCF_Crawford_GM_v3 0 1 1 624 1 G 1 1 1 624 1 G 2 1 624 1 1 C 3 528 1 97 1 A 4 1 108 517 1 G 5 1 526 1 99 C 6 624 1 1 1 A XX DE CTCF_Crawford_GM_v4 0 335 25 71 64 A 1 0 0 494 0 G 2 0 494 0 0 C 3 0 0 494 0 G 4 0 494 0 0 C 5 8 460 13 14 C 6 96 252 114 33 N 7 45 322 63 64 C 8 52 303 93 47 C XX DE CTCF_Crawford_GM_v5 0 1 1 267 1 G 1 1 267 1 1 C 2 267 1 1 1 A 3 1 267 1 1 C 4 1 164 1 104 C 5 1 267 1 1 C 6 1 1 1 267 T XX ==> CTCF_Crawford_HeLa-S3.gem.pfm <== DE CTCF_Crawford_He 0 60 1233 52 30 C 1 911 87 181 195 A 2 103 671 525 76 S 3 164 725 140 346 N 4 1374 0 0 0 A 5 0 0 1374 0 G 6 855 0 519 0 A 7 0 14 1124 236 G 8 0 0 1351 23 G 9 0 0 1374 0 G 10 0 1374 0 0 C 11 734 63 500 78 R XX DE CTCF_Crawford_He_v2 0 73 1154 46 63 C 1 18 1305 8 5 C 2 1183 16 32 105 A 3 0 1042 294 0 C 4 105 668 0 563 Y 5 1335 0 0 0 A 6 5 5 1315 11 G 7 454 123 724 35 R 8 177 106 634 420 N 9 100 96 1074 66 G XX DE CTCF_Crawford_He_v3 0 0 0 544 0 G 1 0 544 0 0 C 2 0 0 544 0 G 3 0 544 0 0 C 4 0 544 0 0 C 5 149 328 0 67 C 6 0 438 0 106 C XX DE CTCF_Crawford_He_v4 0 0 0 637 0 G 1 0 581 0 56 C 2 637 0 0 0 A 3 55 0 582 0 G 4 0 79 0 558 T 5 66 0 476 95 G 6 0 530 0 107 C XX DE CTCF_Crawford_He_v5 0 0 0 632 0 G 1 0 632 0 0 C 2 632 0 0 0 A 3 0 0 632 0 G 4 0 571 0 61 C 5 572 33 12 16 A XX DE CTCF_Crawford_He_v6 0 21 54 176 17 G 1 58 75 110 25 N 2 12 2 27 228 T 3 1 1 266 1 G 4 1 1 266 1 G 5 1 1 1 266 T 6 51 1 216 1 G 7 1 266 1 1 C 8 1 1 1 266 T XX ==> CTCF_Crawford_HepG2.gem.pfm <== DE CTCF_Crawford_He 0 92 2539 66 50 C 1 2033 166 281 268 A 2 168 1554 932 93 S 3 288 1346 182 931 Y 4 2590 22 62 74 A 5 0 0 2746 0 G 6 1160 30 1541 16 R 7 88 51 1692 917 G 8 42 42 2626 37 G 9 105 121 2360 160 G 10 329 2083 110 225 C XX DE CTCF_Crawford_He_v2 0 0 0 539 0 G 1 0 539 0 0 C 2 0 0 539 0 G 3 0 539 0 0 C 4 0 539 0 0 C 5 126 343 0 71 C 6 0 426 0 113 C XX DE CTCF_Crawford_He_v3 0 123 32 576 171 G 1 0 0 901 0 G 2 0 901 0 0 C 3 901 0 0 0 A 4 0 92 809 0 G 5 0 777 0 124 C 6 787 52 22 41 A XX DE CTCF_Crawford_He_v4 0 210 1 273 1 R 1 1 482 1 1 C 2 482 1 1 1 A 3 1 350 1 133 C 4 1 1 1 482 T 5 62 1 421 1 G 6 1 482 1 1 C XX DE CTCF_Crawford_He_v5 0 1 306 1 1 C 1 1 1 1 306 T 2 1 1 306 1 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0 48 85 341 46 G 1 112 55 333 20 G 2 34 60 278 148 K 3 7 5 502 6 G 4 0 0 519 0 G 5 0 519 0 0 C 6 0 0 519 0 G 7 0 519 0 0 C 8 53 136 26 305 Y XX DE CTCF_Stam_AG0931_v4 0 49 154 559 33 G 1 0 795 0 0 C 2 795 0 0 0 A 3 0 0 795 0 G 4 0 750 0 46 C 5 752 18 12 14 A 6 76 126 522 73 G XX DE CTCF_Stam_AG0931_v5 0 1 1 1 251 T 1 1 1 251 1 G 2 1 1 251 1 G 3 1 1 1 251 T 4 1 1 251 1 G 5 1 251 1 1 C 6 1 116 1 136 Y XX ==> CTCF_Stam_AG10803.gem.pfm <== DE CTCF_Stam_AG1080 0 50 1323 50 33 C 1 1025 80 185 166 A 2 100 752 529 76 S 3 190 703 142 421 N 4 1455 0 0 0 A 5 0 0 1455 0 G 6 950 0 505 0 A 7 0 0 1199 256 G 8 0 24 1432 0 G 9 0 0 1455 0 G 10 0 1378 0 78 C 11 750 79 540 87 R XX DE CTCF_Stam_AG1080_v2 0 76 734 91 77 C 1 312 444 82 140 N 2 62 516 92 309 Y 3 0 977 0 0 C 4 0 0 0 977 T 5 617 0 237 123 A 6 0 58 919 0 G 7 105 20 56 796 T 8 0 0 977 0 G 9 0 28 915 35 G XX DE CTCF_Stam_AG1080_v3 0 50 71 367 38 G 1 150 49 294 33 R 2 12 17 240 257 K 3 7 4 512 4 G 4 0 0 525 0 G 5 0 423 0 102 C 6 0 0 525 0 G 7 26 460 24 16 C 8 45 137 27 316 T XX DE CTCF_Stam_AG1080_v4 0 0 0 444 0 G 1 0 0 444 0 G 2 0 444 0 0 C 3 444 0 0 0 A 4 0 88 356 0 G 5 0 360 0 84 C 6 444 0 0 0 A XX DE CTCF_Stam_AG1080_v5 0 1 266 1 1 C 1 1 266 1 1 C 2 1 1 1 266 T 3 1 1 266 1 G 4 1 266 1 1 C 5 1 1 1 266 T 6 1 1 266 1 G XX ==> CTCF_Stam_AoAF.gem.pfm <== DE CTCF_Stam_AoAF_1 0 60 1325 44 25 C 1 1009 85 197 164 A 2 101 758 528 67 S 3 194 709 147 404 N 4 1333 17 59 46 A 5 0 0 1453 0 G 6 877 0 576 0 A 7 0 0 1249 204 G 8 0 0 1453 0 G 9 0 0 1453 0 G 10 0 1453 0 0 C 11 785 62 523 83 R XX DE CTCF_Stam_AoAF_1_v2 0 35 1087 30 0 C 1 0 1152 0 0 C 2 940 65 30 119 A 3 0 1064 58 30 C 4 119 300 0 733 T 5 1152 0 0 0 A 6 0 0 1152 0 G 7 356 115 612 70 R 8 152 100 554 347 N 9 84 102 883 85 G XX DE CTCF_Stam_AoAF_1_v3 0 62 192 481 35 G 1 0 769 0 0 C 2 769 0 0 0 A 3 0 53 716 0 G 4 0 769 0 0 C 5 769 0 0 0 A 6 59 100 566 46 G XX DE CTCF_Stam_AoAF_1_v4 0 66 64 506 28 G 1 66 42 158 398 K 2 0 0 662 0 G 3 0 0 662 0 G 4 0 563 0 99 C 5 66 0 596 0 G 6 8 628 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229 0 47 C 2 215 0 61 0 A 3 0 276 0 0 C 4 0 0 0 276 T 5 50 0 227 0 G 6 0 276 0 0 C XX DE CTCF_Stam_BJ_1_5 0 141 1 114 1 R 1 1 1 254 1 G 2 1 254 1 1 C 3 254 1 1 1 A 4 1 254 1 1 C 5 1 254 1 1 C 6 254 1 1 1 A XX ==> CTCF_Stam_GM12878.gem.pfm <== DE CTCF_Stam_GM1287 0 77 2230 60 47 C 1 1683 168 318 245 A 2 143 1376 803 91 S 3 197 1184 166 868 Y 4 2267 14 63 70 A 5 0 0 2413 0 G 6 1054 7 1346 6 R 7 33 9 1580 793 G 8 24 19 2364 7 G 9 56 82 2185 91 G 10 247 1910 84 172 C 11 1090 153 1042 128 R XX DE CTCF_Stam_GM1287_v2 0 13 494 25 16 C 1 6 534 5 4 C 2 416 6 45 81 A 3 0 547 0 0 C 4 85 126 0 337 T 5 547 0 0 0 A 6 10 7 521 10 G 7 133 74 293 48 N 8 92 85 248 122 N 9 77 79 333 58 G XX DE CTCF_Stam_GM1287_v3 0 1 71 593 99 G 1 1 1 762 1 G 2 1 109 654 1 G 3 1 651 1 112 C 4 1 1 762 1 G 5 1 762 1 1 C 6 1 175 1 588 T XX DE CTCF_Stam_GM1287_v4 0 0 196 462 0 G 1 0 658 0 0 C 2 658 0 0 0 A 3 0 0 658 0 G 4 0 658 0 0 C 5 602 56 0 0 A 6 54 89 457 60 G XX ==> CTCF_Stam_HA-sp.gem.pfm <== DE CTCF_Stam_HA-sp_ 0 80 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0 971 316 0 C 4 107 653 0 528 Y 5 1287 0 0 0 A 6 2 4 1273 9 G 7 462 91 702 33 R 8 168 96 690 334 N 9 72 82 1068 66 G XX DE CTCF_Stam_HCPEpi_v3 0 0 0 494 0 G 1 0 494 0 0 C 2 494 0 0 0 A 3 0 0 494 0 G 4 0 494 0 0 C 5 494 0 0 0 A 6 74 126 295 0 S XX DE CTCF_Stam_HCPEpi_v4 0 1 1 1 282 T 1 1 1 282 1 G 2 1 282 1 1 C 3 265 1 18 1 A 4 40 1 243 1 G 5 1 1 1 282 T 6 79 1 1 204 T XX DE CTCF_Stam_HCPEpi_v5 0 0 0 432 0 G 1 0 372 0 60 C 2 432 0 0 0 A 3 0 0 374 59 G 4 0 62 0 371 T 5 0 0 432 0 G 6 0 340 0 93 C XX ==> CTCF_Stam_HEEpiC.gem.pfm <== DE CTCF_Stam_HEEpiC 0 53 1261 34 22 C 1 976 66 179 149 A 2 91 712 504 64 S 3 166 699 134 372 N 4 1369 0 0 0 A 5 0 0 1369 0 G 6 861 0 508 0 A 7 0 0 1133 236 G 8 0 0 1369 0 G 9 0 0 1369 0 G 10 0 1369 0 0 C 11 707 63 517 83 R XX DE CTCF_Stam_HEEpiC_v2 0 72 888 101 80 C 1 358 534 97 152 N 2 74 612 113 343 Y 3 0 1140 0 0 C 4 0 0 0 1140 T 5 696 0 324 120 A 6 0 72 1068 0 G 7 132 19 60 931 T 8 0 0 1140 0 G 9 0 33 1072 36 G XX DE CTCF_Stam_HEEpiC_v3 0 0 0 538 0 G 1 0 0 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G 1 52 959 40 29 C 2 2 9 1068 1 G 3 0 67 0 1013 T 4 0 0 1079 0 G 5 51 653 348 28 C 6 35 94 900 51 G XX DE Egr-1-PCR2x_Myer_v2 0 14 244 23 555 T 1 0 0 835 0 G 2 835 0 0 0 A 3 3 820 10 4 C 4 10 35 772 18 G XX DE Egr-1-PCR2x_Myer_v3 0 17 40 858 17 G 1 0 930 0 0 C 2 72 0 858 0 G 3 0 930 0 0 C 4 224 522 35 150 M 5 0 0 930 0 G 6 63 644 116 108 C XX DE Egr-1-PCR2x_Myer_v4 0 32 401 117 0 C 1 0 550 0 0 C 2 0 0 550 0 G 3 0 25 525 0 G 4 550 0 0 0 A 5 550 0 0 0 A 6 42 49 460 0 G XX DE Egr-1-PCR2x_Myer_v5 0 0 0 468 0 G 1 0 0 364 104 G 2 0 0 468 0 G 3 0 0 468 0 G 4 0 0 468 0 G 5 0 468 0 0 C 6 0 0 468 0 G XX DE Egr-1-PCR2x_Myer_v6 0 1 1 1 346 T 1 346 1 1 1 A 2 1 346 1 1 C 3 1 1 346 1 G 4 1 246 7 93 C XX DE Egr-1-PCR2x_Myer_v7 0 1 1 164 1 G 1 164 1 1 1 A 2 1 164 1 1 C 3 1 1 164 1 G 4 1 164 1 1 C 5 164 1 1 1 A XX DE Egr-1-PCR2x_Myer_v8 0 1 143 1 1 C 1 1 1 1 143 T 2 1 143 1 1 C 3 1 143 1 1 C 4 1 1 143 1 G 5 1 143 1 1 C 6 1 1 143 1 G XX ==> Egr-1-v041610.1_Myers_GM12878.gem.pfm <== DE Egr-1-v041610.1_ 0 200 335 1425 111 G 1 363 1151 253 305 N 2 41 54 1954 23 G 3 0 0 1375 696 G 4 160 0 1912 0 G 5 0 0 2071 0 G 6 0 0 2071 0 G 7 0 1596 0 475 C 8 3 2 2064 2 G 9 151 210 1414 297 G XX DE Egr-1-v041610.1__v2 0 5 883 6 12 C 1 0 904 0 0 C 2 0 904 0 0 C 3 348 288 268 0 N 4 0 904 0 0 C 5 0 0 904 0 G 6 2 865 31 7 C XX DE Egr-1-v041610.1__v3 0 53 1 621 1 G 1 1 615 1 58 C 2 1 1 673 1 G 3 1 673 1 1 C 4 1 1 673 1 G 5 58 524 93 1 C 6 316 253 106 1 M XX DE Egr-1-v041610.1__v4 0 1 1 1 470 T 1 1 1 1 470 T 2 1 470 1 1 C 3 1 470 1 1 C 4 1 1 470 1 G 5 1 143 327 1 G XX DE Egr-1-v041610.1__v5 0 1 264 1 1 C 1 1 264 1 1 C 2 1 264 1 1 C 3 1 1 264 1 G 4 1 264 1 1 C 5 1 264 1 1 C 6 1 1 264 1 G XX ==> Egr-1-v041610.1_Myers_K562.gem.pfm <== DE Egr-1-v041610.1_ 0 287 361 1855 143 G 1 434 1329 268 615 N 2 8 30 2599 9 G 3 0 0 1501 1145 K 4 191 0 2454 0 G 5 0 0 2645 0 G 6 0 0 2645 0 G 7 41 1867 38 700 C 8 21 4 2606 15 G 9 198 201 1728 518 G XX DE Egr-1-v041610.1__v2 0 0 1341 0 0 C 1 0 1341 0 0 C 2 34 1274 0 33 C 3 706 282 354 0 N 4 0 1341 0 0 C 5 190 0 985 167 G 6 0 1341 0 0 C XX ==> Egr-1-v041610.2_Myers_H1-hESC.gem.pfm <== DE Egr-1-v041610.2_ 0 106 190 1217 59 G 1 247 1135 86 102 C 2 24 34 1502 11 G 3 1 2 1152 416 G 4 64 0 1506 0 G 5 0 0 1570 0 G 6 2 4 1563 2 G 7 99 1293 24 155 C 8 41 55 1441 34 G XX DE Egr-1-v041610.2__v2 0 1 1 311 1 G 1 1 1 311 1 G 2 311 1 1 1 A 3 1 55 258 1 G 4 1 1 311 1 G 5 1 1 311 1 G 6 311 1 1 1 A 7 1 1 311 1 G XX DE Egr-1-v041610.2__v3 0 15 209 31 1 C 1 1 253 1 1 C 2 1 1 253 1 G 3 1 1 253 1 G 4 253 1 1 1 A 5 234 1 21 1 A 6 1 1 253 1 G 7 33 26 26 171 T XX ==> ELF1--SC-631-v041610.1_Myers_GM12878.gem.pfm <== DE ELF1--SC-631-v04 0 0 1147 46 51 C 1 20 40 13 1171 T 2 8 0 56 1180 T 3 0 1238 0 5 C 4 0 1243 0 0 C 5 0 37 985 221 G 6 16 200 985 43 G XX DE ELF1--SC-631-v04_v2 0 0 0 572 0 G 1 86 455 0 32 C 2 48 0 524 0 G 3 39 533 0 0 C 4 100 414 0 59 C 5 0 0 572 0 G 6 39 516 0 17 C XX DE ELF1--SC-631-v04_v3 0 1 344 1 1 C 1 1 1 1 344 T 2 1 268 77 1 C 3 1 344 1 1 C 4 1 1 344 1 G 5 1 344 1 1 C 6 73 1 207 65 R XX DE ELF1--SC-631-v04_v4 0 364 1 1 1 A 1 36 102 227 1 G 2 115 1 204 46 R 3 1 1 364 1 G 4 1 364 1 1 C 5 1 1 364 1 G 6 1 364 1 1 C XX DE ELF1--SC-631-v04_v5 0 50 273 0 25 C 1 348 0 0 0 A 2 49 0 299 0 G 3 0 348 0 0 C 4 0 273 75 0 C 5 0 0 348 0 G 6 0 348 0 0 C XX ==> ELF1--SC-631-v041610.1_Myers_HepG2.gem.pfm <== DE ELF1--SC-631-v04 0 211 1456 638 103 C 1 760 1647 0 0 C 2 0 0 2407 0 G 3 0 26 2381 0 G 4 2407 0 0 0 A 5 2371 0 0 36 A 6 194 134 2080 0 G XX DE ELF1--SC-631-v04_v2 0 0 0 0 296 T 1 0 107 189 0 G 2 0 296 0 0 C 3 0 0 296 0 G 4 0 296 0 0 C 5 0 0 296 0 G XX ==> ELF1--SC-631-v041610.2_Myers_K562.gem.pfm <== DE ELF1--SC-631-v04 0 9 2364 106 184 C 1 28 25 18 2591 T 2 9 0 19 2634 T 3 0 2661 0 0 C 4 0 2661 0 0 C 5 0 0 2021 640 G 6 22 467 2085 88 G XX DE ELF1--SC-631-v04_v2 0 1 1 470 1 G 1 1 1 470 1 G 2 470 1 1 1 A 3 470 1 1 1 A 4 1 1 470 1 G 5 1 103 1 368 T 6 1 76 395 1 G XX DE ELF1--SC-631-v04_v3 0 1 1 261 104 G 1 1 97 1 267 T 2 1 1 59 306 T 3 1 364 1 1 C 4 1 364 1 1 C 5 1 1 364 1 G 6 1 364 1 1 C XX DE ELF1--SC-631-v04_v4 0 1 1 1 295 T 1 1 1 295 1 G 2 1 54 242 1 G 3 1 295 1 1 C 4 1 1 295 1 G 5 1 210 86 1 C 6 1 222 1 73 C XX ==> ERalpha-a-v041610.2_Myers_ECC-1-Genistein-100nM.gem.pfm <== DE ERalpha-a-v04161 0 1051 63 487 0 A 1 0 0 1600 0 G 2 0 0 1600 0 G 3 0 0 0 1600 T 4 0 1600 0 0 C 5 1522 0 78 0 A XX DE ERalpha-a-v04161_v2 0 0 0 313 0 G 1 0 212 0 101 C 2 0 0 0 313 T 3 0 0 313 0 G 4 313 0 0 0 A 5 0 313 0 0 C XX DE ERalpha-a-v04161_v3 0 1 1 1 298 T 1 1 1 298 1 G 2 1 1 1 298 T 3 1 1 298 1 G 4 298 1 1 1 A 5 1 298 1 1 C XX ==> ERalpha-a-v041610.2_Myers_T-47D-Estradiol-10nM.gem.pfm <== DE ERalpha-a-v04161 0 0 31 0 2485 T 1 0 0 2516 0 G 2 2247 269 0 0 A 3 0 2516 0 0 C 4 383 2134 0 0 C 5 0 501 76 1939 T XX DE ERalpha-a-v04161_v2 0 0 0 298 0 G 1 153 0 0 145 W 2 0 0 0 298 T 3 0 0 298 0 G 4 298 0 0 0 A 5 0 298 0 0 C XX ==> ERalpha-a-v041610.2_Myers_T-47D-Genistein-100nM.gem.pfm <== DE ERalpha-a-v04161 0 0 29 0 1960 T 1 0 0 1988 0 G 2 1988 0 0 0 A 3 0 1988 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<== DE FOSL1--SC-183-v0 0 0 0 0 2371 T 1 0 0 2300 72 G 2 2356 15 0 0 A 3 0 0 2289 83 G 4 0 0 0 2371 T 5 0 2371 0 0 C 6 2371 0 0 0 A 7 31 988 437 916 Y XX DE FOSL1--SC-183-v0_v2 0 0 229 52 0 C 1 0 0 0 281 T 2 0 0 0 281 T 3 281 0 0 0 A 4 0 0 0 281 T 5 0 281 0 0 C 6 96 0 0 185 T XX ==> FOSL2-v041610.1_Myers_HepG2.gem.pfm <== DE FOSL2-v041610.1_ 0 0 0 0 1443 T 1 0 0 1417 26 G 2 1443 0 0 0 A 3 102 1342 0 0 C 4 0 0 34 1410 T 5 46 1397 0 0 C 6 1432 0 11 0 A XX DE FOSL2-v041610.1__v2 0 0 0 0 302 T 1 0 0 302 0 G 2 0 0 0 302 T 3 0 0 0 302 T 4 0 0 72 230 T 5 187 0 115 0 A 6 0 302 0 0 C XX ==> FOXA1--SC-101058-v041610.1_Myers_HepG2.gem.pfm <== DE FOXA1--SC-101058 0 164 0 2309 0 G 1 0 336 0 2137 T 2 2154 319 0 0 A 3 2339 134 0 0 A 4 2446 0 27 0 A 5 0 2081 0 392 C 6 2367 26 14 67 A XX DE FOXA1--SC-101058_v2 0 435 5 1 16 A 1 0 456 0 0 C 2 456 0 0 0 A 3 456 0 0 0 A 4 456 0 0 0 A 5 33 287 29 109 C 6 370 39 17 31 A XX DE FOXA1--SC-101058_v3 0 1 1 468 1 G 1 1 1 168 301 T 2 168 1 95 207 N 3 1 468 1 1 C 4 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GABP-v041610.1_M_v4 0 0 346 0 0 C 1 0 0 346 0 G 2 0 238 0 108 C 3 0 0 346 0 G 4 346 0 0 0 A 5 0 201 145 0 S XX DE GABP-v041610.1_M_v5 0 281 0 0 0 A 1 0 281 0 0 C 2 0 0 281 0 G 3 0 281 0 0 C 4 0 182 99 0 C 5 0 0 281 0 G XX ==> GATA-1_Snyder_K562b.gem.pfm <== DE GATA-1_Snyder_K5 0 1664 110 0 581 A 1 0 0 2354 0 G 2 2354 0 0 0 A 3 0 0 0 2354 T 4 2354 0 0 0 A 5 2144 0 210 0 A XX DE GATA-1_Snyder_K5_v2 0 605 0 0 0 A 1 0 0 0 605 T 2 0 605 0 0 C 3 267 0 0 338 W 4 0 0 605 0 G 5 0 605 0 0 C XX ==> GATA2-eGFP_White_K562.gem.pfm <== DE GATA2-eGFP_White 0 1093 0 0 382 A 1 0 0 1475 0 G 2 1475 0 0 0 A 3 0 0 0 1475 T 4 1475 0 0 0 A 5 1270 0 205 0 A XX ==> GATA2--SC-267-PCR1x_Myers_K562.gem.pfm <== DE GATA2--SC-267-PC 0 1976 65 0 669 A 1 0 0 2709 0 G 2 2709 0 0 0 A 3 0 0 0 2709 T 4 2709 0 0 0 A 5 2432 0 277 0 A XX DE GATA2--SC-267-PC_v2 0 0 494 0 0 C 1 0 0 0 494 T 2 290 0 0 204 W 3 494 0 0 0 A 4 0 0 0 494 T 5 0 494 0 0 C XX DE GATA2--SC-267-PC_v3 0 0 420 0 0 C 1 420 0 0 0 A 2 0 0 420 0 G 3 0 420 0 0 C 4 0 0 0 420 T 5 0 0 420 0 G XX DE GATA2--SC-267-PC_v4 0 603 0 0 0 A 1 0 0 0 603 T 2 0 603 0 0 C 3 226 0 0 378 T 4 0 0 603 0 G 5 0 603 0 0 C XX ==> GATA-2_Snyder_K562b.gem.pfm <== DE GATA-2_Snyder_K5 0 1479 70 0 544 A 1 0 0 2092 0 G 2 2092 0 0 0 A 3 0 0 0 2092 T 4 2092 0 0 0 A 5 1854 0 238 0 A XX DE GATA-2_Snyder_K5_v2 0 0 0 325 0 G 1 0 325 0 0 C 2 325 0 0 0 A 3 0 0 325 0 G 4 325 0 0 0 A 5 0 0 0 325 T XX ==> GATA3--SC-268-v041610.2_Myers_T-47D-DMSO-0.02pct.gem.pfm <== DE GATA3--SC-268-v0 0 0 0 0 837 T 1 0 0 0 837 T 2 837 0 0 0 A 3 0 0 0 837 T 4 0 837 0 0 C 5 264 0 0 574 T XX DE GATA3--SC-268-v0_v2 0 0 0 0 542 T 1 542 0 0 0 A 2 0 0 0 542 T 3 0 542 0 0 C 4 153 0 0 389 T 5 0 193 349 0 G XX DE GATA3--SC-268-v0_v3 0 344 0 0 0 A 1 0 0 0 344 T 2 0 344 0 0 C 3 0 0 0 344 T 4 0 0 344 0 G 5 344 0 0 0 A XX DE GATA3--SC-268-v0_v4 0 0 0 304 0 G 1 0 304 0 0 C 2 304 0 0 0 A 3 304 0 0 0 A 4 304 0 0 0 A 5 0 304 0 0 C XX ==> GR-PCR1x_Myers_A549-DEX-50nM.gem.pfm <== DE GR-PCR1x_Myers_A 0 484 0 672 0 R 1 0 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GR-PCR2x_Myers_A 0 1204 14 1433 86 R 1 0 0 2737 0 G 2 1434 0 1144 160 R 3 2737 0 0 0 A 4 0 2737 0 0 C 5 2654 15 30 39 A XX DE GR-PCR2x_Myers_A_v2 0 0 0 628 0 G 1 0 628 0 0 C 2 628 0 0 0 A 3 0 628 0 0 C 4 548 0 80 0 A 5 0 0 628 0 G XX DE GR-PCR2x_Myers_A_v3 0 1 446 1 1 C 1 1 1 446 1 G 2 1 1 1 446 T 3 1 152 1 294 T 4 1 446 1 1 C 5 1 336 1 111 C XX DE GR-PCR2x_Myers_A_v4 0 0 817 0 0 C 1 737 0 80 0 A 2 0 0 817 0 G 3 0 0 817 0 G 4 221 0 596 0 G 5 0 817 0 0 C XX DE GR-PCR2x_Myers_A_v5 0 1 1 1 273 T 1 1 1 273 1 G 2 273 1 1 1 A 3 1 273 1 1 C 4 1 1 273 1 G 5 6 55 26 188 T XX DE GR-PCR2x_Myers_A_v6 0 268 19 46 12 A 1 1 341 1 1 C 2 1 1 341 1 G 3 1 341 1 1 C 4 1 1 1 341 T 5 9 39 264 32 G XX DE GR-PCR2x_Myers_A_v7 0 1 264 1 1 C 1 1 1 264 1 G 2 1 1 1 264 T 3 1 1 264 1 G 4 1 1 264 1 G 5 1 166 99 1 C XX ==> HNF4A--SC-8987-v041610.1_Myers_HepG2.gem.pfm <== DE HNF4A--SC-8987-v 0 151 110 88 770 T 1 82 12 999 27 G 2 304 23 739 53 G 3 925 193 0 0 A 4 22 1096 0 0 C 5 0 48 0 1070 T 6 5 144 16 954 T 7 11 46 22 1040 T 8 106 36 918 59 G 9 278 240 420 181 N 10 378 326 167 249 N 11 136 718 108 157 C XX DE HNF4A--SC-8987-v_v2 0 1 1 665 1 G 1 105 61 66 435 T 2 44 125 72 426 T 3 1 665 1 1 C 4 665 1 1 1 A 5 665 1 1 1 A 6 585 1 81 1 A 7 1 1 665 1 G XX DE HNF4A--SC-8987-v_v3 0 1 1 1 520 T 1 1 1 520 1 G 2 1 1 1 520 T 3 1 1 1 520 T 4 1 1 1 520 T 5 101 1 420 1 G 6 1 424 1 96 C XX DE HNF4A--SC-8987-v_v4 0 1 306 1 1 C 1 306 1 1 1 A 2 219 1 88 1 A 3 306 1 1 1 A 4 1 1 306 1 G 5 1 1 306 1 G 6 29 1 216 63 G 7 1 306 1 1 C XX ==> HNF4A_Snyder_HepG2-forskolin.gem.pfm <== DE HNF4A_Snyder_Hep 0 131 107 102 624 T 1 72 23 831 39 G 2 180 91 647 46 G 3 873 77 5 8 A 4 0 963 0 0 C 5 0 0 0 963 T 6 5 190 24 745 T 7 24 34 28 877 T 8 79 50 783 52 G 9 235 215 375 140 N 10 323 315 152 174 N 11 107 617 91 149 C XX DE HNF4A_Snyder_Hep_v2 0 0 605 0 24 C 1 524 105 0 0 A 2 563 28 39 0 A 3 590 0 39 0 A 4 0 0 629 0 G 5 0 43 586 0 G 6 35 35 97 463 T 7 0 548 35 47 C XX DE HNF4A_Snyder_Hep_v3 0 3 8 8 281 T 1 0 0 300 0 G 2 0 0 0 300 T 3 0 0 0 300 T 4 0 0 0 300 T 5 139 0 161 0 R 6 1 291 5 4 C XX ==> HNF4G--SC-6558-v041610.1_Myers_HepG2.gem.pfm <== DE HNF4G--SC-6558-v 0 150 112 93 661 T 1 93 15 875 33 G 2 116 41 789 70 G 3 953 62 0 0 A 4 21 994 0 0 C 5 0 55 0 960 T 6 0 118 0 898 T 7 17 46 18 936 T 8 90 35 838 53 G 9 263 212 364 177 N 10 339 352 112 213 N 11 144 627 93 151 C XX DE HNF4G--SC-6558-v_v2 0 104 43 432 90 G 1 146 94 215 214 N 2 141 176 170 182 N 3 0 625 17 27 C 4 636 32 0 0 A 5 618 0 51 0 A 6 629 0 39 0 A 7 18 0 651 0 G 8 30 0 639 0 G 9 27 0 92 549 T 10 25 548 33 63 C XX DE HNF4G--SC-6558-v_v3 0 10 3 4 543 T 1 1 1 557 1 G 2 1 1 557 1 G 3 557 1 1 1 A 4 1 557 1 1 C 5 9 111 4 435 T XX DE HNF4G--SC-6558-v_v4 0 0 0 301 0 G 1 0 183 0 118 C 2 301 0 0 0 A 3 301 0 0 0 A 4 301 0 0 0 A 5 0 301 0 0 C 6 297 3 0 2 A XX ==> HSF1_Snyder_HepG2-forskolin.gem.pfm <== DE HSF1_Snyder_HepG 0 16 36 0 381 T 1 0 0 38 395 T 2 0 432 0 0 C 3 0 7 0 426 T 4 68 0 365 0 G 5 0 0 432 0 G 6 418 14 0 0 A 7 432 0 0 0 A 8 105 114 142 72 N 9 91 139 139 64 N 10 70 68 80 215 N 11 84 52 87 209 N 12 41 280 84 28 C XX DE HSF1_Snyder_HepG_v2 0 1 1 1 783 T 1 1 1 43 741 T 2 677 1 107 1 A 3 1 67 22 696 T 4 102 1 682 1 G 5 1 663 1 121 C 6 783 1 1 1 A 7 783 1 1 1 A XX DE HSF1_Snyder_HepG_v3 0 10 8 263 7 G 1 6 9 6 266 T 2 1 33 5 249 T 3 0 18 269 0 G 4 0 287 0 0 C 5 0 243 0 44 C 6 265 11 3 9 A 7 29 25 63 171 K 8 31 16 236 4 G 9 32 24 210 22 G XX DE HSF1_Snyder_HepG_v4 0 23 223 132 3 S 1 1 379 1 1 C 2 1 1 379 1 G 3 1 1 379 1 G 4 379 1 1 1 A 5 379 1 1 1 A 6 39 24 309 9 G XX ==> JunB-eGFP_White_K562.gem.pfm <== DE JunB-eGFP_White_ 0 0 0 0 1342 T 1 0 0 1297 45 G 2 1329 13 0 0 A 3 67 294 963 19 G 4 0 0 0 1342 T 5 25 1311 0 7 C 6 1342 0 0 0 A 7 16 214 97 1017 T XX DE JunB-eGFP_White__v2 0 407 9 33 183 A 1 1 1 630 1 G 2 630 1 1 1 A 3 1 1 1 630 T 4 630 1 1 1 A 5 630 1 1 1 A 6 44 75 494 19 G XX ==> JunD-eGFP_White_K562.gem.pfm <== DE JunD-eGFP_White_ 0 600 73 166 11 A 1 0 0 0 849 T 2 0 0 842 7 G 3 849 0 0 0 A 4 8 622 184 36 C 5 17 0 16 817 T 6 13 831 0 5 C 7 849 0 0 0 A XX DE JunD-eGFP_White__v2 0 427 17 34 146 A 1 3 5 615 1 G 2 623 0 0 0 A 3 0 0 0 623 T 4 586 0 0 37 A 5 587 3 11 23 A 6 113 32 454 25 G XX DE JunD-eGFP_White__v3 0 322 1 1 1 A 1 1 322 1 1 C 2 1 1 1 322 T 3 1 1 99 224 T 4 1 322 1 1 C 5 1 322 1 1 C 6 1 1 52 271 T XX ==> JunD-PCR1x_Myers_HepG2.gem.pfm <== DE JunD-PCR1x_Myers 0 0 0 0 1140 T 1 0 0 1140 0 G 2 1140 0 0 0 A 3 79 1062 0 0 C 4 0 0 31 1110 T 5 36 1104 0 0 C 6 1140 0 0 0 A XX DE JunD-PCR1x_Myers_v2 0 0 0 0 370 T 1 0 0 370 0 G 2 0 0 0 370 T 3 0 0 0 370 T 4 0 0 89 282 T 5 239 0 131 0 A 6 0 370 0 0 C XX ==> JunD_Snyder_GM12878.gem.pfm <== DE JunD_Snyder_GM12 0 0 0 0 2166 T 1 0 0 1908 258 G 2 2166 0 0 0 A 3 176 1990 0 0 C 4 0 0 12 2154 T 5 305 1861 0 0 C 6 2166 0 0 0 A XX DE JunD_Snyder_GM12_v2 0 1410 29 230 174 A 1 1 560 1282 1 G 2 1 1 1 1841 T 3 1 1 1 1841 T 4 1 1 1 1841 T 5 1 1841 1 1 C 6 1409 131 80 223 A XX DE JunD_Snyder_GM12_v3 0 249 0 838 0 G 1 1087 0 0 0 A 2 990 0 0 97 A 3 784 135 169 0 A 4 0 0 0 1087 T 5 0 0 1087 0 G 6 1087 0 0 0 A XX DE JunD_Snyder_GM12_v4 0 1082 1 1 1 A 1 1 237 846 1 G 2 1 1 1 1082 T 3 1 1082 1 1 C 4 1082 1 1 1 A 5 36 42 37 969 T XX DE JunD_Snyder_GM12_v5 0 0 0 0 304 T 1 0 0 304 0 G 2 0 26 0 278 T 3 0 0 304 0 G 4 0 0 304 0 G 5 0 0 0 304 T 6 0 0 0 304 T XX ==> JunD_Snyder_HeLa-S3.gem.pfm <== DE JunD_Snyder_HeLa 0 1965 101 300 15 A 1 0 0 0 2379 T 2 0 0 2339 40 G 3 2379 0 0 0 A 4 61 1693 478 148 C 5 18 0 8 2354 T 6 65 2307 8 0 C 7 2379 0 0 0 A XX DE JunD_Snyder_HeLa_v2 0 269 1 1 1 A 1 1 32 238 1 G 2 1 1 188 82 G 3 1 1 1 269 T 4 1 1 269 1 G 5 1 1 269 1 G 6 1 269 1 1 C XX ==> JunD-v041610.2_Myers_H1-hESC.gem.pfm <== DE JunD-v041610.2_M 0 0 0 0 432 T 1 0 0 432 0 G 2 423 9 0 0 A 3 0 41 391 0 G 4 0 0 0 432 T 5 0 432 0 0 C 6 432 0 0 0 A 7 0 166 51 215 Y XX DE JunD-v041610.2_M_v2 0 1 1 347 1 G 1 1 307 1 40 C 2 1 1 347 1 G 3 28 320 1 1 C 4 1 347 1 1 C 5 1 1 347 1 G 6 1 347 1 1 C XX DE JunD-v041610.2_M_v3 0 12 346 11 4 C 1 6 13 349 5 G 2 1 370 1 1 C 3 1 1 1 370 T 4 1 234 138 1 C 5 1 370 1 1 C 6 1 1 370 1 G 7 31 270 49 23 C XX DE JunD-v041610.2_M_v4 0 34 185 22 18 C 1 1 1 256 1 G 2 1 256 1 1 C 3 1 256 1 1 C 4 137 120 1 1 M 5 1 1 1 256 T 6 1 256 1 1 C 7 1 7 8 242 T XX ==> Max_Snyder_GM12878.gem.pfm <== DE Max_Snyder_GM128 0 55 2207 0 0 C 1 2261 0 0 0 A 2 0 1733 0 528 C 3 0 0 2261 0 G 4 81 100 0 2081 T 5 0 0 2261 0 G XX DE Max_Snyder_GM128_v2 0 0 0 427 0 G 1 0 0 0 427 T 2 0 0 427 0 G 3 0 0 427 0 G 4 0 0 0 427 T 5 0 0 0 427 T XX DE Max_Snyder_GM128_v3 0 232 109 181 0 N 1 0 0 521 0 G 2 0 0 0 521 T 3 0 521 0 0 C 4 521 0 0 0 A 5 0 521 0 0 C XX DE Max_Snyder_GM128_v4 0 8 200 16 76 C 1 0 0 0 300 T 2 0 0 0 300 T 3 0 300 0 0 C 4 0 300 0 0 C 5 0 0 300 0 G XX DE Max_Snyder_GM128_v5 0 269 0 0 0 A 1 123 0 146 0 R 2 0 269 0 0 C 3 0 0 269 0 G 4 0 0 0 269 T 5 0 0 269 0 G XX DE Max_Snyder_GM128_v6 0 1 1 1 398 T 1 1 85 314 1 G 2 1 270 1 129 C 3 81 1 318 1 G 4 1 398 1 1 C 5 1 1 398 1 G XX ==> Max_Snyder_HeLa-S3.gem.pfm <== DE Max_Snyder_HeLa- 0 0 993 0 0 C 1 831 0 162 0 A 2 0 606 0 387 C 3 0 0 993 0 G 4 0 0 0 993 T 5 0 0 993 0 G XX DE Max_Snyder_HeLa-_v2 0 0 0 676 0 G 1 676 0 0 0 A 2 0 91 585 0 G 3 0 0 0 676 T 4 0 676 0 0 C 5 676 0 0 0 A XX ==> Max_Snyder_HUVEC.gem.pfm <== DE Max_Snyder_HUVEC 0 0 2831 0 0 C 1 2831 0 0 0 A 2 0 2099 0 733 C 3 0 0 2831 0 G 4 150 287 0 2394 T 5 0 0 2831 0 G XX DE Max_Snyder_HUVEC_v2 0 1 1 449 1 G 1 1 449 1 1 C 2 209 1 241 1 R 3 1 1 1 449 T 4 1 1 449 1 G 5 1 449 1 1 C XX DE Max_Snyder_HUVEC_v3 0 1 1 1 786 T 1 1 1 786 1 G 2 1 786 1 1 C 3 1 1 786 1 G 4 1 295 1 492 T 5 1 150 637 1 G XX DE Max_Snyder_HUVEC_v4 0 1 1 300 1 G 1 1 1 1 300 T 2 1 145 156 1 S 3 300 1 1 1 A 4 1 300 1 1 C 5 1 1 300 1 G XX ==> Max_Snyder_K562.gem.pfm <== DE Max_Snyder_K562_ 0 0 3528 0 0 C 1 3274 0 255 0 A 2 0 3528 0 0 C 3 552 0 2976 0 G 4 130 0 0 3399 T 5 0 0 3528 0 G XX DE Max_Snyder_K562__v2 0 1 1 1161 1 G 1 1 1161 1 1 C 2 176 1 986 1 G 3 1 1161 1 1 C 4 243 1 919 1 G 5 210 783 42 129 C XX DE Max_Snyder_K562__v3 0 0 439 0 0 C 1 0 0 439 0 G 2 0 0 0 439 T 3 0 0 439 0 G 4 151 0 288 0 G 5 0 439 0 0 C XX DE Max_Snyder_K562__v4 0 1 1 311 1 G 1 1 311 1 1 C 2 1 1 311 1 G 3 1 1 1 311 T 4 1 1 311 1 G 5 1 1 1 311 T XX DE Max_Snyder_K562__v5 0 1 268 1 1 C 1 268 1 1 1 A 2 1 1 1 268 T 3 1 1 268 1 G 4 1 268 1 1 C 5 1 1 268 1 G XX DE Max_Snyder_K562__v6 0 180 1 124 1 R 1 1 303 1 1 C 2 1 1 303 1 G 3 1 1 1 303 T 4 1 303 1 1 C 5 303 1 1 1 A XX ==> Max-v041610.2_Myers_K562.gem.pfm <== DE Max-v041610.2_My 0 0 2175 0 0 C 1 1667 0 333 176 A 2 0 2175 0 0 C 3 510 0 1665 0 G 4 0 0 0 2175 T 5 0 0 2175 0 G XX DE Max-v041610.2_My_v2 0 1 1 268 1 G 1 1 1 268 1 G 2 268 1 1 1 A 3 1 1 268 1 G 4 1 268 1 1 C 5 1 1 268 1 G XX ==> MEF2A-PCR1x_Myers_GM12878.gem.pfm <== DE MEF2A-PCR1x_Myer 0 51 239 29 231 Y 1 330 55 53 113 W 2 354 0 103 94 A 3 550 0 0 0 A 4 487 0 0 64 A 5 550 0 0 0 A 6 0 0 0 550 T 7 550 0 0 0 A 8 0 0 550 0 G XX DE MEF2A-PCR1x_Myer_v2 0 110 0 0 383 T 1 0 0 493 0 G 2 0 0 0 493 T 3 0 0 493 0 G 4 0 0 493 0 G 5 0 0 0 493 T 6 0 118 0 376 T XX DE MEF2A-PCR1x_Myer_v3 0 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1 1 351 1 G 2 351 1 1 1 A 3 351 1 1 1 A 4 351 1 1 1 A 5 1 192 160 1 S 6 1 1 1 351 T XX DE MEF2C--SC-13268-_v5 0 0 0 0 280 T 1 0 0 0 280 T 2 0 0 0 280 T 3 0 280 0 0 C 4 223 29 29 0 A 5 0 0 280 0 G 6 0 0 0 280 T XX DE MEF2C--SC-13268-_v6 0 287 0 0 0 A 1 287 0 0 0 A 2 287 0 0 0 A 3 0 0 0 287 T 4 196 0 91 0 A 5 287 0 0 0 A 6 0 287 0 0 C XX ==> NF-E2_Snyder_K562.gem.pfm <== DE NF-E2_Snyder_K56 0 52 113 3028 96 G 1 168 2953 103 66 C 2 110 167 28 2984 T 3 134 58 2935 163 G 4 3084 17 13 175 A 5 104 459 2670 56 G 6 7 6 8 3268 T 7 30 3224 17 18 C 8 3246 13 17 13 A 9 25 955 121 2188 T XX DE NF-E2_Snyder_K56_v2 0 322 10 103 4 A 1 3 3 4 429 T 2 1 4 432 2 G 3 438 0 0 0 A 4 0 438 0 0 C 5 0 0 0 438 T 6 74 7 71 288 T 7 9 6 290 134 G 8 48 168 216 8 S 9 160 239 12 27 M 10 248 38 71 83 N 11 166 54 92 127 N 12 160 27 42 210 W 13 125 35 20 259 W XX DE NF-E2_Snyder_K56_v3 0 7 5 467 0 G 1 6 8 2 463 T 2 0 478 0 0 C 3 478 0 0 0 A 4 0 447 6 26 C 5 13 0 465 0 G 6 0 1 0 477 T 7 0 0 478 0 G XX ==> NFKB_Snyder_GM10847.gem.pfm <== DE NFKB_Snyder_GM10 0 73 18 522 18 G 1 34 5 584 7 G 2 518 3 109 1 A 3 628 2 0 0 A 4 547 10 9 65 A 5 79 53 175 323 N 6 20 410 0 199 C 7 1 628 0 0 C 8 2 623 3 2 C 9 28 582 8 11 C XX DE NFKB_Snyder_GM10_v2 0 205 38 76 14 A 1 32 2 284 15 G 2 4 3 326 1 G 3 326 5 2 1 A 4 331 1 1 1 A 5 1 67 264 1 G 6 1 1 1 331 T 7 1 2 322 9 G 8 225 11 79 19 A XX ==> NFKB_Snyder_GM12878.gem.pfm <== DE NFKB_Snyder_GM12 0 104 11 495 31 G 1 40 0 600 0 G 2 596 6 38 0 A 3 640 0 0 0 A 4 527 17 38 60 A 5 74 44 72 452 T 6 23 559 0 59 C 7 0 640 0 0 C 8 0 640 0 0 C 9 0 629 0 11 C XX DE NFKB_Snyder_GM12_v2 0 14 2 8 406 T 1 1 1 343 84 G 2 1 1 1 427 T 3 1 1 427 1 G 4 1 1 427 1 G 5 1 1 1 427 T 6 2 8 4 415 T 7 46 21 64 298 T XX DE NFKB_Snyder_GM12_v3 0 22 15 347 29 G 1 1 1 321 91 G 2 278 1 134 1 A 3 1 216 52 144 Y 4 1 1 1 411 T 5 1 1 1 411 T 6 1 265 14 132 C 7 1 408 2 3 C 8 6 392 6 9 C XX DE NFKB_Snyder_GM12_v4 0 21 35 21 475 T 1 6 113 11 423 T 2 1 1 1 551 T 3 1 551 1 1 C 4 487 1 1 65 A 5 1 199 260 94 S 6 1 1 3 549 T 7 4 24 13 513 T XX ==> NFKB_Snyder_GM12878-TNFa.gem.pfm <== DE NFKB_Snyder_GM12 0 283 27 1012 42 G 1 1218 25 112 9 A 2 1352 7 3 2 A 3 1053 43 46 221 A 4 95 96 282 891 T 5 0 1032 0 331 C 6 3 1358 0 2 C 7 12 1338 5 10 C 8 82 1192 20 70 C XX DE NFKB_Snyder_GM12_v2 0 56 1 602 1 G 1 1 1 1 657 T 2 1 1 657 1 G 3 1 101 557 1 G 4 1 1 1 657 T 5 1 1 1 657 T 6 48 1 46 564 T XX DE NFKB_Snyder_GM12_v3 0 1 1 628 1 G 1 143 1 485 1 G 2 1 1 628 1 G 3 87 1 541 1 G 4 628 1 1 1 A 5 628 1 1 1 A 6 133 71 425 1 G 7 1 55 1 574 T XX DE NFKB_Snyder_GM12_v4 0 1 1 1 544 T 1 1 1 492 53 G 2 544 1 1 1 A 3 58 396 57 35 C 4 1 1 1 544 T 5 69 475 1 1 C 6 544 1 1 1 A XX DE NFKB_Snyder_GM12_v5 0 1 1 1 322 T 1 1 60 1 263 T 2 1 1 1 322 T 3 1 322 1 1 C 4 322 1 1 1 A 5 1 123 200 1 G 6 1 1 1 322 T 7 1 1 1 322 T XX DE NFKB_Snyder_GM12_v6 0 285 1 1 1 A 1 1 123 1 164 Y 2 1 1 1 285 T 3 1 1 1 285 T 4 1 285 1 1 C 5 1 285 1 1 C 6 7 4 1 276 T XX ==> NFKB_Snyder_GM12891.gem.pfm <== DE NFKB_Snyder_GM12 0 125 56 535 36 G 1 183 28 500 40 G 2 708 0 42 0 A 3 742 0 8 0 A 4 563 30 87 71 A 5 90 44 90 527 T 6 36 664 0 51 C 7 19 731 0 0 C 8 0 750 0 0 C 9 0 750 0 0 C XX DE NFKB_Snyder_GM12_v2 0 43 30 120 295 T 1 16 3 410 58 G 2 0 0 0 487 T 3 0 0 487 0 G 4 0 0 487 0 G 5 0 38 0 449 T 6 4 5 8 471 T 7 65 30 48 346 T XX DE NFKB_Snyder_GM12_v3 0 279 48 427 48 R 1 1 1 800 1 G 2 1 1 800 1 G 3 800 1 1 1 A 4 800 1 1 1 A 5 134 180 487 1 G 6 2 17 1 781 T XX DE NFKB_Snyder_GM12_v4 0 1 1 1 332 T 1 1 1 332 1 G 2 332 1 1 1 A 3 33 26 274 1 G 4 1 1 1 332 T 5 39 294 1 1 C 6 332 1 1 1 A XX DE NFKB_Snyder_GM12_v5 0 1 1 281 1 G 1 97 1 185 1 G 2 1 1 1 281 T 3 1 1 1 281 T 4 1 183 1 99 C 5 1 281 1 1 C 6 1 281 1 1 C XX ==> NFKB_Snyder_GM12892.gem.pfm <== DE NFKB_Snyder_GM12 0 99 22 677 33 G 1 75 12 730 13 G 2 741 9 78 2 A 3 829 0 0 0 A 4 697 0 33 99 A 5 52 96 211 471 K 6 17 609 0 204 C 7 2 826 0 2 C 8 21 798 7 5 C 9 60 713 25 32 C XX ==> NFKB_Snyder_GM15510.gem.pfm <== DE NFKB_Snyder_GM15 0 29 1 324 1 G 1 10 1 343 1 G 2 329 7 18 1 A 3 352 1 1 1 A 4 276 14 22 41 A 5 33 20 47 253 T 6 1 321 1 32 C 7 1 352 1 1 C 8 1 352 1 1 C 9 11 342 1 1 C XX DE NFKB_Snyder_GM15_v2 0 21 158 14 102 Y 1 11 25 218 42 G 2 12 255 15 13 C 3 1 286 6 2 C 4 81 211 3 0 C 5 0 169 0 125 Y 6 0 294 0 0 C 7 0 0 0 294 T 8 32 21 226 16 G 9 10 146 132 7 S 10 11 41 7 236 T 11 4 12 264 16 G 12 31 40 198 26 G XX ==> NFKB_Snyder_GM18505.gem.pfm <== DE NFKB_Snyder_GM18 0 99 37 588 47 G 1 84 13 656 17 G 2 642 21 103 4 A 3 767 2 1 0 A 4 654 15 20 80 A 5 118 66 176 409 N 6 13 531 0 225 C 7 1 766 2 1 C 8 21 742 1 6 C 9 57 658 23 32 C XX DE NFKB_Snyder_GM18_v2 0 59 387 69 71 C 1 584 1 1 1 A 2 1 497 88 1 C 3 48 1 1 537 T 4 1 1 1 584 T 5 4 569 4 9 C 6 2 572 6 6 C 7 21 139 21 405 T XX DE NFKB_Snyder_GM18_v3 0 437 74 31 40 A 1 512 52 12 5 A 2 563 1 1 17 A 3 60 416 105 1 C 4 1 580 1 1 C 5 580 1 1 1 A 6 2 573 4 3 C 7 269 256 6 51 M XX ==> NFKB_Snyder_GM18526.gem.pfm <== DE NFKB_Snyder_GM18 0 44 10 493 12 G 1 20 4 534 1 G 2 523 6 29 1 A 3 558 0 0 0 A 4 474 9 24 52 A 5 52 70 128 309 N 6 12 382 0 165 C 7 1 557 0 0 C 8 5 551 2 1 C 9 31 501 9 19 C XX DE NFKB_Snyder_GM18_v2 0 23 179 32 27 C 1 11 226 11 12 C 2 162 15 50 34 A 3 6 166 82 7 C 4 11 191 3 56 C 5 260 0 0 0 A 6 0 0 260 0 G 7 115 0 145 0 R 8 0 0 186 74 G 9 0 0 260 0 G 10 4 11 236 9 G 11 22 207 18 14 C 12 102 12 137 9 R 13 15 143 94 9 S XX DE NFKB_Snyder_GM18_v3 0 26 273 28 17 C 1 325 2 11 6 A 2 3 265 50 27 C 3 4 1 1 338 T 4 1 1 1 342 T 5 1 342 1 1 C 6 1 342 1 1 C 7 2 14 5 323 T 8 13 205 96 30 S XX ==> NFKB_Snyder_GM18951.gem.pfm <== DE NFKB_Snyder_GM18 0 40 4 387 12 G 1 6 6 430 1 G 2 366 2 75 0 A 3 441 0 0 1 A 4 348 0 24 71 A 5 66 52 84 241 N 6 9 353 0 80 C 7 10 432 0 0 C 8 1 441 0 0 C 9 9 417 6 11 C XX DE NFKB_Snyder_GM18_v2 0 36 156 24 220 Y 1 24 23 334 55 G 2 19 377 20 21 C 3 4 412 4 16 C 4 158 264 8 6 C 5 2 255 5 174 Y 6 1 433 2 0 C 7 6 12 3 415 T 8 97 13 282 44 G 9 9 182 229 16 S 10 33 38 17 347 T 11 14 18 397 7 G 12 42 35 319 40 G XX DE NFKB_Snyder_GM18_v3 0 286 12 22 15 A 1 2 77 252 5 G 2 263 45 27 1 A 3 1 1 333 1 G 4 1 1 333 1 G 5 333 1 1 1 A 6 333 1 1 1 A 7 33 44 258 1 G 8 6 15 4 311 T XX ==> NFKB_Snyder_GM19099.gem.pfm <== DE NFKB_Snyder_GM19 0 62 12 327 22 G 1 31 0 391 0 G 2 390 7 26 0 A 3 422 0 0 0 A 4 336 10 28 49 A 5 35 34 32 321 T 6 11 370 0 42 C 7 0 422 0 0 C 8 0 416 6 0 C 9 0 422 0 0 C XX DE NFKB_Snyder_GM19_v2 0 12 145 21 235 Y 1 15 13 345 41 G 2 10 379 8 16 C 3 2 397 1 14 C 4 90 321 0 1 C 5 0 208 0 204 Y 6 0 412 0 0 C 7 22 16 9 366 T 8 91 24 259 38 G 9 14 133 244 23 S 10 25 70 29 289 T 11 16 41 339 17 G 12 57 51 269 35 G XX DE NFKB_Snyder_GM19_v3 0 411 87 54 18 A 1 1 501 5 63 C 2 1 1 1 568 T 3 1 1 1 568 T 4 1 568 1 1 C 5 2 559 1 8 C 6 4 8 9 548 T 7 24 222 262 61 S 8 57 94 24 396 T XX DE NFKB_Snyder_GM19_v4 0 171 8 90 36 R 1 9 11 280 4 G 2 1 1 1 302 T 3 1 1 1 302 T 4 1 1 1 302 T 5 1 302 1 1 C 6 273 4 6 21 A 7 27 15 197 65 G XX ==> NFKB_Snyder_GM19193.gem.pfm <== DE NFKB_Snyder_GM19 0 41 6 491 10 G 1 2 1 541 4 G 2 439 0 108 1 A 3 547 0 0 0 A 4 497 0 12 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1 C 2 1 1 328 1 G 3 1 278 1 51 C 4 328 1 1 1 A 5 1 1 328 1 G 6 10 276 36 9 C XX DE PAX5-C20-v041610_v6 0 1 254 1 1 C 1 138 1 117 1 R 2 1 1 254 1 G 3 254 1 1 1 A 4 1 1 254 1 G 5 1 254 1 1 C 6 1 1 254 1 G XX DE PAX5-C20-v041610_v7 0 30 235 59 28 C 1 169 80 44 59 N 2 41 92 181 38 N 3 64 50 195 42 N 4 2 2 346 2 G 5 2 346 2 2 C 6 2 346 2 2 C 7 2 346 2 2 C 8 2 2 346 2 G 9 2 346 2 2 C XX ==> PAX5-C20-v041610.1_Myers_GM12892.gem.pfm <== DE PAX5-C20-v041610 0 21 125 557 1 G 1 1 701 1 1 C 2 97 1 605 1 G 3 1 1 1 701 T 4 1 53 649 1 G 5 469 77 157 1 A 6 1 701 1 1 C XX DE PAX5-C20-v041610_v2 0 65 0 783 0 G 1 0 759 0 89 C 2 40 0 592 216 G 3 0 848 0 0 C 4 0 0 848 0 G 5 0 848 0 0 C 6 19 691 102 37 C XX DE PAX5-C20-v041610_v3 0 0 750 0 0 C 1 0 0 750 0 G 2 0 750 0 0 C 3 0 0 283 468 T 4 0 628 0 122 C 5 0 392 358 0 S 6 7 5 738 1 G XX DE PAX5-C20-v041610_v4 0 1 1 1 696 T 1 1 119 578 1 G 2 1 103 594 1 G 3 1 696 1 1 C 4 1 1 696 1 G 5 1 171 526 1 G 6 15 663 13 8 C XX DE PAX5-C20-v041610_v5 0 398 1 1 1 A 1 62 337 1 1 C 2 1 398 1 1 C 3 1 1 398 1 G 4 1 398 1 1 C 5 1 98 301 1 G 6 15 35 338 12 G XX ==> POU2F2-PCR1x_Myers_GM12878.gem.pfm <== DE POU2F2-PCR1x_Mye 0 366 27 27 43 A 1 4 2 5 451 T 2 19 5 2 438 T 3 16 0 0 446 T 4 0 0 462 0 G 5 0 462 0 0 C 6 459 1 1 2 A 7 5 3 7 448 T XX ==> POU2F2-PCR1x_Myers_GM12891.gem.pfm <== DE POU2F2-PCR1x_Mye 0 35 46 17 216 T 1 313 0 0 0 A 2 0 0 0 313 T 3 0 0 313 0 G 4 0 298 0 15 C 5 303 0 0 11 A 6 294 0 11 8 A 7 313 0 0 0 A 8 17 16 13 267 T XX ==> POU5F1--SC-9081-v041610.2_Myers_H1-hESC.gem.pfm <== DE POU5F1--SC-9081- 0 147 57 32 810 T 1 116 94 813 23 G 2 111 921 8 5 C 3 1038 1 2 5 A 4 0 0 0 1045 T 5 585 75 349 37 R 6 935 2 3 106 A 7 19 738 173 117 C 8 977 18 14 37 A 9 963 28 26 30 A 10 546 44 53 403 W XX DE POU5F1--SC-9081-_v2 0 719 15 10 34 A 1 12 4 1 761 T 2 1 0 775 2 G 3 2 680 0 96 C 4 618 4 1 155 A 5 638 14 78 48 A 6 751 8 14 5 A 7 72 27 81 598 T XX ==> PU.1-PCR1x_Myers_GM12878.gem.pfm <== DE PU.1-PCR1x_Myers 0 1909 202 744 56 A 1 224 8 2661 18 G 2 0 0 2910 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A 5 0 83 246 114 K 6 0 0 0 442 T 7 0 0 0 442 T 8 0 442 0 0 C XX DE PU.1-PCR1x_Myers_v4 0 1 398 1 1 C 1 1 398 1 1 C 2 1 1 1 398 T 3 1 204 1 195 Y 4 1 1 1 398 T 5 1 1 1 398 T 6 1 1 1 398 T XX ==> PU.1-PCR1x_Myers_K562.gem.pfm <== DE PU.1-PCR1x_Myers 0 450 306 2453 64 G 1 2364 168 720 21 A 2 67 1 3198 7 G 3 0 0 3272 0 G 4 3272 0 0 0 A 5 3272 0 0 0 A 6 38 230 3003 2 G 7 150 165 105 2853 T 8 163 624 2375 111 G XX DE PU.1-PCR1x_Myers_v2 0 845 0 0 0 A 1 0 264 582 0 G 2 624 68 153 0 A 3 0 0 845 0 G 4 0 0 845 0 G 5 845 0 0 0 A 6 845 0 0 0 A XX DE PU.1-PCR1x_Myers_v3 0 21 631 20 36 C 1 706 1 1 1 A 2 1 706 1 1 C 3 1 1 1 706 T 4 1 1 1 706 T 5 1 706 1 1 C 6 47 239 14 408 Y XX ==> RXRA-PCR1x_Myers_HepG2.gem.pfm <== DE RXRA-PCR1x_Myers 0 1059 185 363 111 A 1 1398 15 248 57 A 2 11 1 1698 8 G 3 0 0 1595 123 G 4 51 91 167 1409 T 5 0 1657 0 61 C 6 1532 76 35 74 A XX DE RXRA-PCR1x_Myers_v2 0 34 15 18 818 T 1 202 0 682 0 G 2 0 0 0 884 T 3 0 0 77 807 T 4 0 0 85 799 T 5 544 0 340 0 A 6 0 884 0 0 C XX DE RXRA-PCR1x_Myers_v3 0 242 1 121 1 A 1 89 274 1 1 C 2 1 362 1 1 C 3 1 1 1 362 T 4 1 1 1 362 T 5 1 1 1 362 T 6 1 1 362 1 G XX ==> RXRA-v041610.2_Myers_H1-hESC.gem.pfm <== DE RXRA-v041610.2_M 0 0 0 0 836 T 1 0 0 836 0 G 2 836 0 0 0 A 3 0 836 0 0 C 4 0 836 0 0 C 5 0 358 0 478 Y XX ==> SREBP1_Snyder_HepG2-pravastatin.gem.pfm <== DE SREBP1_Snyder_He 0 65 10 54 6 R 1 2 6 1 126 T 2 1 131 0 3 C 3 131 1 2 1 A 4 0 134 0 0 C 5 23 67 44 0 S 6 0 102 0 32 C 7 2 126 7 0 C 8 131 0 1 3 A 9 1 60 15 59 Y XX DE SREBP1_Snyder_He_v2 0 3 119 5 5 C 1 2 125 3 2 C 2 130 1 1 1 A 3 111 1 17 2 A 4 0 0 0 131 T 5 0 128 2 1 C 6 124 3 3 2 A 7 10 13 103 6 G XX DE SREBP1_Snyder_He_v3 0 2 71 2 4 C 1 8 66 2 3 C 2 78 0 0 0 A 3 0 0 0 78 T 4 0 0 0 78 T 5 0 0 78 0 G 6 1 0 75 2 G 7 8 53 5 13 C XX DE SREBP1_Snyder_He_v4 0 2 2 2 45 T 1 2 2 45 2 G 2 45 2 2 2 A 3 2 45 2 2 C 4 2 2 45 2 G 5 2 45 2 2 C 6 2 2 45 2 G XX ==> SRF-PCR1x_Myers_H1-hESC.gem.pfm <== DE SRF-PCR1x_Myers_ 0 9 1314 5 7 C 1 6 1307 3 17 C 2 219 90 7 1018 T 3 54 7 5 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468 T 4 1 1 1 468 T 5 1 468 1 1 C 6 1 468 1 1 C 7 3 12 152 303 T 8 5 118 310 37 G XX ==> SRF-v041610.1_Myers_HepG2.gem.pfm <== DE SRF-v041610.1_My 0 30 881 37 93 C 1 706 76 53 206 A 2 450 70 84 437 W 3 1040 0 0 0 A 4 324 0 0 716 T 5 1040 0 0 0 A 6 762 0 0 278 A 7 0 0 1040 0 G 8 0 0 1040 0 G XX DE SRF-v041610.1_My_v2 0 0 356 0 0 C 1 0 0 0 356 T 2 0 0 0 356 T 3 0 356 0 0 C 4 0 356 0 0 C 5 0 0 356 0 G XX DE SRF-v041610.1_My_v3 0 0 0 0 342 T 1 0 0 342 0 G 2 342 0 0 0 A 3 0 342 0 0 C 4 0 0 342 0 G 5 7 148 16 171 Y XX DE SRF-v041610.1_My_v4 0 197 0 0 308 T 1 66 0 0 440 T 2 0 0 0 505 T 3 0 0 505 0 G 4 0 0 505 0 G 5 0 505 0 0 C XX DE SRF-v041610.1_My_v5 0 167 1 1 293 T 1 1 1 1 459 T 2 1 459 1 1 C 3 1 459 1 1 C 4 1 1 459 1 G 5 1 108 352 1 G XX ==> SRF-v041610.1_Myers_K562.gem.pfm <== DE SRF-v041610.1_My 0 7 677 3 3 C 1 6 671 3 9 C 2 153 87 17 432 T 3 22 5 1 660 T 4 612 2 3 73 A 5 1 3 1 683 T 6 418 8 4 259 A 7 113 3 3 571 T 8 23 3 663 1 G 9 4 2 673 10 G XX DE SRF-v041610.1_My_v2 0 35 353 41 10 C 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STAT1_Snyder_K56_v4 0 76 6 1 16 A 1 0 0 98 0 G 2 98 0 0 0 A 3 0 0 0 98 T 4 98 0 0 0 A 5 98 0 0 0 A 6 0 0 98 0 G XX DE STAT1_Snyder_K56_v5 0 5 120 5 5 C 1 5 5 5 120 T 2 5 5 120 5 G 3 120 5 5 5 A 4 5 120 5 5 C 5 5 5 120 5 G 6 5 5 120 5 G XX DE STAT1_Snyder_K56_v6 0 2 3 14 91 T 1 1 108 1 1 C 2 1 1 1 108 T 3 1 1 108 1 G 4 108 1 1 1 A 5 1 1 108 1 G 6 1 28 1 81 T XX DE STAT1_Snyder_K56_v7 0 3 3 91 3 G 1 3 3 3 91 T 2 3 91 3 3 C 3 91 3 3 3 A 4 3 91 3 3 C 5 3 3 91 3 G 6 5 19 33 42 N 7 3 12 71 13 G XX ==> STAT1_Snyder_K562-IFNa6h.gem.pfm <== DE STAT1_Snyder_K56 0 459 51 82 45 A 1 279 104 141 113 N 2 144 158 170 165 N 3 0 0 636 0 G 4 636 0 0 0 A 5 636 0 0 0 A 6 636 0 0 0 A 7 0 549 87 0 C 8 0 136 23 477 T XX DE STAT1_Snyder_K56_v2 0 193 34 435 1 G 1 1 1 661 1 G 2 1 1 661 1 G 3 531 1 131 1 A 4 661 1 1 1 A 5 661 1 1 1 A XX DE STAT1_Snyder_K56_v3 0 0 185 0 0 C 1 0 0 0 185 T 2 0 0 0 185 T 3 185 0 0 0 A 4 0 0 0 185 T 5 0 185 0 0 C XX DE STAT1_Snyder_K56_v4 0 1 1 1 93 T 1 1 1 1 93 T 2 1 1 1 93 T 3 1 93 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STAT1_Snyder_K562-IFNg6h.gem.pfm <== DE STAT1_Snyder_K56 0 0 0 0 816 T 1 0 0 15 801 T 2 37 772 8 0 C 3 31 759 0 26 C 4 563 253 0 0 A 5 41 0 775 0 G 6 19 0 771 27 G 7 816 0 0 0 A 8 816 0 0 0 A XX DE STAT1_Snyder_K56_v2 0 46 273 74 28 C 1 32 333 35 22 C 2 245 37 109 30 R 3 13 247 151 11 S 4 19 348 28 27 C 5 405 8 6 3 A 6 0 2 419 1 G 7 186 5 230 1 R 8 6 7 329 80 G 9 4 15 401 2 G 10 7 35 359 20 G 11 40 334 20 29 C 12 103 30 252 37 R XX ==> TCF12-PCR1x_Myers_GM12878.gem.pfm <== DE TCF12-PCR1x_Myer 0 0 1532 0 0 C 1 1532 0 0 0 A 2 0 296 1236 0 G 3 0 1395 137 0 C 4 0 0 0 1532 T 5 0 0 1532 0 G 6 5 1109 311 108 C XX ==> TCF4_Snyder_HCT-116.gem.pfm <== DE TCF4_Snyder_HCT- 0 0 679 26 40 C 1 0 35 0 709 T 2 0 0 0 744 T 3 0 0 0 744 T 4 0 81 663 0 G 5 669 0 0 75 A 6 164 0 0 580 T 7 68 354 287 37 S XX DE TCF4_Snyder_HCT-_v2 0 0 0 0 351 T 1 0 0 351 0 G 2 351 0 0 0 A 3 0 351 0 0 C 4 0 0 0 351 T 5 0 351 0 0 C 6 329 0 23 0 A XX ==> USF-1-PCR1x_Myers_A549-EtOH-0.02pct.gem.pfm <== DE USF-1-PCR1x_Myer 0 6 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