Table_S9 TF1 TF2 Max_Distance Max_Distance_Combine AP-2alpha CTCF 1 1 AP-2alpha GABP 4 4 AP-2alpha JunD 3 3 AP-2alpha Max 8 8 AP-2alpha STAT1 13 13 AP-2alpha c-Fos 3 3 AP-2alpha c-Jun 3 3 AP-2alpha c-Myc 6 6 AP-2gamma CTCF 3 3 2 1 AP-2gamma GABP 4 4 AP-2gamma JunD 3 3 AP-2gamma Max 13 13 AP-2gamma STAT1 0 0 AP-2gamma c-Fos 3 3 3 AP-2gamma c-Jun 3 3 AP-2gamma c-Myc 6 20 6 CTCF GABP 2 2 CTCF JunD 13 13 8 16 CTCF Max 11 7 11 2 CTCF NRSF 4 1 4 CTCF STAT1 28 4 28 27 CTCF c-Fos 11 1 11 9 CTCF c-Myc 2 2 1 0 2 GABP JunD 5 5 5 GABP Max 12 12 GABP NRSF 4 4 GABP STAT1 4 4 GABP c-Fos 9 9 GABP c-Jun 9 9 GABP c-Myc 12 12 JunD Max 6 6 6 JunD NRSF 12 12 JunD STAT1 10 10 JunD c-Myc 6 3 6 Max NRSF 1 1 Max Nrf1 0 0 0 Max STAT1 6 6 Max c-Fos 3 3 Max c-Jun 3 3 NRSF c-Fos 2 2 NRSF c-Jun 12 12 NRSF c-Myc 23 23 Nrf1 c-Myc 5 0 5 STAT1 c-Fos 23 23 STAT1 c-Jun 9 9 STAT1 c-Myc 19 0 19 c-Fos c-Myc 15 6 15 c-Jun c-Myc 15 6 15 3 ---------------------------------- HeLa-S3 48 BHLHE40 FOSL2 20 20 BHLHE40 FOXA1 8 8 7 BHLHE40 FOXA2 7 7 BHLHE40 HNF4A 12 12 BHLHE40 JunD 10 10 BHLHE40 RXRA 4 4 BHLHE40 USF1 0 0 BHLHE40 c-Myc 1 1 CEBPB CTCF 11 18 7 11 8 CEBPB ELF1 14 14 CEBPB ERRA 6 6 CEBPB FOSL2 11 11 CEBPB FOXA1 3 3 2 CEBPB FOXA2 2 2 CEBPB GABP 6 6 CEBPB HNF4A 3 3 3 CEBPB HNF4G 13 13 CEBPB HSF1 2 2 CEBPB JunD 3 3 CEBPB RXRA 26 26 CEBPB SRF 7 7 CEBPB USF1 11 11 CEBPB c-Myc 0 0 0 CTCF ELF1 30 30 23 19 22 29 CTCF FOSL2 12 12 4 7 1 CTCF FOXA1 62 24 23 41 40 62 18 26 25 CTCF FOXA2 11 23 5 11 3 CTCF HNF4A 14 6 19 32 18 11 14 26 13 CTCF HNF4G 11 6 36 11 35 CTCF JunD 12 12 2 3 19 CTCF RXRA 15 3 4 2 15 CTCF SRF 13 25 24 13 17 CTCF USF1 8 7 21 17 8 CTCF c-Myc 1 1 0 4 1 1 ELF1 FOSL2 5 5 ELF1 FOXA1 15 15 4 ELF1 FOXA2 4 4 ELF1 GABP 2 2 ELF1 HNF4A 0 0 0 ELF1 HNF4G 0 0 ELF1 HSF1 1 1 ELF1 JunD 7 7 ELF1 RXRA 3 3 ELF1 SRF 6 6 ELF1 USF1 12 12 ELF1 c-Myc 19 19 ERRA FOXA1 3 3 2 ERRA FOXA2 2 2 ERRA HNF4A 4 3 4 ERRA HNF4G 9 9 ERRA JunD 10 10 ERRA RXRA 0 0 ERRA USF1 5 5 FOSL2 FOXA1 4 4 3 4 FOSL2 FOXA2 3 3 FOSL2 GABP 19 19 FOSL2 HNF4A 20 1 20 FOSL2 HNF4G 6 6 FOSL2 HSF1 2 2 FOSL2 RXRA 9 9 FOSL2 SRF 0 0 FOSL2 USF1 6 6 FOSL2 c-Myc 5 5 FOXA1 HNF4A 5 5 5 4 4 FOXA1 HNF4G 5 5 4 FOXA1 HSF1 12 18 12 FOXA1 JunD 4 4 3 FOXA1 RXRA 3 3 2 FOXA1 SRF 2 1 2 FOXA1 USF1 13 12 13 FOXA1 c-Myc 6 5 6 FOXA2 GABP 2 2 2 FOXA2 HNF4A 4 4 4 FOXA2 HNF4G 4 4 FOXA2 JunD 3 3 FOXA2 RXRA 2 2 FOXA2 SRF 2 2 FOXA2 USF1 12 12 FOXA2 c-Myc 6 6 GABP HNF4A 30 30 30 GABP HNF4G 6 6 GABP JunD 5 5 GABP SRF 12 12 GABP USF1 14 14 GABP c-Myc 15 15 HNF4A HSF1 5 3 5 HNF4A JunD 11 11 10 HNF4A RXRA 3 3 3 HNF4A SRF 9 9 9 HNF4A USF1 26 8 26 HNF4A c-Myc 7 7 7 HNF4G HSF1 8 8 8 HNF4G JunD 5 5 HNF4G RXRA 3 3 HNF4G SRF 6 6 HNF4G USF1 7 7 HNF4G c-Myc 7 7 HSF1 JunD 7 7 7 JunD RXRA 15 15 JunD SRF 3 3 JunD USF1 6 6 JunD c-Myc 6 6 RXRA SRF 5 5 RXRA USF1 5 5 RXRA c-Myc 5 5 SRF USF1 4 0 4 SRF c-Myc 20 20 ---------------------------------- HepG2 107 CTCF EBF 1 2 1 1 CTCF EBF1 1 2 1 1 1 CTCF ELF1 0 1 0 0 CTCF Egr-1 4 5 4 4 CTCF MEF2A 12 12 4 11 CTCF PAX5 11 11 10 7 CTCF POU2F2 2 2 2 10 CTCF PU.1 14 14 32 16 CTCF SRF 5 5 4 0 CTCF TCF12 3 3 1 2 CTCF YY1 8 7 8 CTCF ZEB1 5 5 0 4 EBF ELF1 8 8 EBF ETS1 5 5 EBF Egr-1 1 1 EBF JunD 8 8 EBF MEF2A 2 2 EBF MEF2C 23 23 EBF Max 12 12 EBF NFKB 4 4 4 EBF PAX5 0 0 EBF POU2F2 10 10 EBF PU.1 5 5 EBF SRF 2 2 EBF TCF12 1 1 EBF ZEB1 3 3 EBF c-Jun 7 7 EBF c-Myc 21 21 EBF1 ELF1 10 10 EBF1 ETS1 5 5 EBF1 Egr-1 0 0 EBF1 JunD 2 2 EBF1 MEF2A 16 16 EBF1 MEF2C 10 10 EBF1 Max 14 14 EBF1 NFKB 4 4 4 EBF1 PAX5 7 7 EBF1 POU2F2 10 10 EBF1 PU.1 5 5 EBF1 SRF 8 8 EBF1 TCF12 16 16 EBF1 ZEB1 43 43 EBF1 c-Jun 23 23 EBF1 c-Myc 21 21 ELF1 ETS1 2 2 2 ELF1 Egr-1 4 4 4 ELF1 GABP 3 3 ELF1 MEF2A 15 15 ELF1 NFKB 4 3 4 ELF1 PAX5 6 6 ELF1 POU2F2 8 8 ELF1 PU.1 2 2 ELF1 SRF 5 5 ELF1 TCF12 2 2 ELF1 USF1 9 9 ELF1 ZEB1 4 4 ELF1 c-Myc 25 25 ETS1 Egr-1 2 2 ETS1 MEF2A 8 8 ETS1 MEF2C 14 14 ETS1 Max 34 34 ETS1 NFKB 9 9 2 ETS1 PAX5 10 10 ETS1 POU2F2 15 15 ETS1 PU.1 0 0 ETS1 SRF 17 17 ETS1 TCF12 16 16 ETS1 USF1 33 33 ETS1 ZEB1 14 14 ETS1 c-Jun 5 5 Egr-1 GABP 9 9 Egr-1 MEF2A 10 10 Egr-1 MEF2C 38 38 Egr-1 Max 0 0 Egr-1 NFKB 9 9 9 Egr-1 PAX5 6 0 6 Egr-1 POU2F2 13 13 Egr-1 PU.1 2 2 Egr-1 SRF 4 4 Egr-1 TCF12 3 3 Egr-1 USF1 2 2 Egr-1 ZEB1 1 1 Egr-1 c-Myc 2 2 2 3 GABP PAX5 3 3 GABP PU.1 1 1 GABP SRF 6 6 GABP TCF12 2 2 JunD MEF2A 13 13 JunD MEF2C 14 14 JunD NFKB 12 20 12 JunD PAX5 4 4 JunD POU2F2 16 16 JunD PU.1 20 20 JunD SRF 9 9 JunD TCF12 12 12 MEF2A NFKB 11 11 11 MEF2A PAX5 13 13 MEF2A POU2F2 1 1 MEF2A PU.1 8 8 MEF2A SRF 0 0 MEF2A TCF12 7 7 MEF2A ZEB1 2 2 MEF2A c-Jun 12 12 MEF2C NFKB 14 11 14 18 MEF2C PAX5 7 7 MEF2C POU2F2 12 12 MEF2C PU.1 8 8 MEF2C SRF 0 0 MEF2C TCF12 6 6 MEF2C c-Jun 13 13 Max PAX5 0 0 Max POU2F2 17 17 Max TCF12 44 44 Max c-Jun 3 3 NFKB PAX5 19 19 35 NFKB POU2F2 15 1 15 NFKB PU.1 2 2 2 NFKB SRF 26 26 9 NFKB TCF12 8 8 8 NFKB c-Jun 14 6 14 NFKB c-Myc 14 14 NRSF PAX5 4 4 4 NRSF TCF12 5 5 PAX5 POU2F2 4 4 4 PAX5 PU.1 14 14 PAX5 SRF 11 11 PAX5 TCF12 4 4 PAX5 USF1 1 1 PAX5 ZEB1 19 19 PAX5 c-Jun 3 3 PAX5 c-Myc 3 2 3 POU2F2 PU.1 17 17 17 POU2F2 SRF 20 20 POU2F2 TCF12 10 10 POU2F2 ZEB1 0 0 POU2F2 c-Jun 15 15 POU2F2 c-Myc 7 7 5 PU.1 SRF 47 47 7 47 PU.1 TCF12 25 25 PU.1 c-Jun 5 5 PU.1 c-Myc 26 26 SRF TCF12 7 7 1 SRF ZEB1 8 8 SRF c-Jun 1 1 TCF12 ZEB1 2 2 TCF12 c-Jun 6 6 TCF12 c-Myc 10 10 c-Jun c-Myc 6 6 ---------------------------------- GM12878 148 CTCF Egr-1 0 5 0 0 CTCF JunD 10 1 10 CTCF NRSF 24 24 24 3 3 CTCF RXRA 3 2 3 CTCF SRF 10 10 1 CTCF USF1 27 27 7 CTCF YY1 8 8 4 Egr-1 JunD 25 25 2 Egr-1 USF1 3 3 Egr-1 YY1 5 5 JunD NRSF 7 7 7 7 JunD POU5F1 20 20 JunD RXRA 7 7 JunD SRF 5 5 JunD USF1 4 4 JunD YY1 6 6 NRSF YY1 4 4 4 POU5F1 YY1 12 12 RXRA USF1 5 5 RXRA YY1 7 7 SRF USF1 12 12 SRF YY1 47 47 USF1 YY1 4 4 4 ---------------------------------- H1 23 CTCF ELF1 26 25 32 26 CTCF Egr-1 3 8 4 3 3 CTCF GABP 15 5 13 15 CTCF JunB 11 16 11 9 CTCF JunD 9 0 9 5 CTCF Max 9 3 9 2 CTCF NRSF 7 6 3 7 CTCF PU.1 28 28 37 34 CTCF STAT1 2 2 43 2 CTCF USF1 8 8 42 18 CTCF YY1 6 6 6 6 4 2 8 7 11 7 CTCF c-Jun 9 3 4 9 CTCF c-Myc 30 7 15 0 16 30 30 26 24 27 10 13 19 1 13 ELF1 Egr-1 8 8 8 ELF1 FOS 5 5 5 ELF1 FOSL1 5 5 ELF1 GABP 1 1 ELF1 GATA1 30 30 ELF1 GATA2 30 13 30 19 ELF1 JunB 4 4 ELF1 JunD 6 6 ELF1 Max 13 13 ELF1 NRSF 12 12 ELF1 PU.1 0 0 ELF1 SRF 10 10 ELF1 STAT1 4 4 4 3 ELF1 USF1 9 9 ELF1 YY1 5 2 5 ELF1 c-Jun 6 5 6 5 6 ELF1 c-Myc 28 16 36 22 34 28 Egr-1 FOS 37 37 Egr-1 FOSL1 37 37 Egr-1 GABP 5 5 Egr-1 GATA1 14 14 Egr-1 GATA2 14 14 16 20 Egr-1 JunB 36 36 Egr-1 JunD 38 38 Egr-1 Max 4 4 3 Egr-1 NRSF 11 11 Egr-1 PU.1 2 2 Egr-1 SRF 13 13 Egr-1 USF1 2 2 Egr-1 YY1 13 13 78 Egr-1 c-Jun 37 37 37 15 36 Egr-1 c-Myc 2 2 2 3 2 2 FOS GABP 31 31 FOS GATA1 12 12 FOS GATA2 21 21 20 21 FOS Max 3 3 FOS NF-E2 2 2 FOS NRSF 8 8 FOS PU.1 5 5 FOS USF1 4 4 FOS YY1 13 7 13 FOS c-Myc 5 5 5 4 4 FOSL1 GABP 5 5 5 FOSL1 GATA1 21 21 FOSL1 GATA2 14 12 14 25 FOSL1 Max 3 3 FOSL1 NF-E2 2 2 FOSL1 NRSF 11 11 FOSL1 PU.1 5 5 FOSL1 SRF 4 4 FOSL1 USF1 4 4 FOSL1 YY1 7 7 7 FOSL1 c-Myc 5 5 5 5 4 GABP GATA1 15 6 15 GABP GATA2 8 8 5 20 GABP JunB 17 17 GABP JunD 4 4 GABP Max 0 0 GABP NRSF 1 1 GABP PU.1 1 1 GABP SRF 15 15 GABP STAT1 5 5 GABP USF1 14 14 GABP YY1 6 6 3 GABP c-Jun 6 5 6 6 0 GABP c-Myc 14 16 14 13 11 4 GATA1 JunB 16 16 GATA1 JunD 15 15 GATA1 Max 24 24 GATA1 NRSF 1 1 GATA1 PU.1 11 11 GATA1 USF1 19 19 GATA1 YY1 17 17 GATA1 c-Jun 26 26 16 GATA1 c-Myc 13 11 25 13 12 GATA2 JunB 13 16 13 11 18 GATA2 JunD 24 20 24 22 GATA2 Max 28 28 11 24 GATA2 NRSF 5 5 17 1 GATA2 PU.1 11 22 18 11 GATA2 STAT1 56 56 55 GATA2 USF1 14 14 26 11 GATA2 YY1 24 24 16 4 9 5 GATA2 c-Jun 16 11 14 17 10 21 20 19 16 12 12 16 16 GATA2 c-Myc 13 16 12 11 16 12 11 14 13 59 13 13 16 13 12 JunB Max 2 2 JunB NF-E2 3 3 JunB NRSF 16 16 JunB PU.1 6 6 JunB SRF 15 15 JunB STAT1 14 14 JunB USF1 3 3 JunB YY1 6 5 6 JunB c-Myc 4 4 4 2 3 3 JunD Max 34 34 4 34 JunD NF-E2 1 1 JunD NRSF 3 3 JunD PU.1 6 6 JunD SRF 0 0 JunD STAT1 12 12 11 JunD USF1 5 5 JunD YY1 12 3 12 JunD c-Myc 6 6 6 7 4 5 Max NF-E2 5 4 5 5 Max NRSF 9 9 1 Max PU.1 35 35 Max SRF 9 9 Max STAT1 10 10 Max YY1 3 2 2 2 3 3 3 Max c-Jun 3 8 3 4 3 2 NF-E2 PU.1 37 37 NF-E2 USF1 6 6 NF-E2 YY1 11 11 NF-E2 c-Jun 3 2 3 2 3 NF-E2 c-Myc 7 7 6 NRSF PU.1 19 19 19 NRSF SRF 17 17 NRSF STAT1 2 2 NRSF USF1 6 6 NRSF YY1 10 10 3 NRSF c-Jun 22 11 22 10 22 NRSF c-Myc 6 0 6 10 12 6 PU.1 SRF 10 10 10 PU.1 USF1 34 34 PU.1 YY1 33 33 PU.1 c-Jun 6 5 6 5 6 PU.1 c-Myc 16 16 SRF STAT1 33 33 33 34 33 SRF USF1 1 1 SRF YY1 28 7 28 47 SRF c-Jun 1 1 SRF c-Myc 15 26 15 32 STAT1 YY1 61 61 STAT1 c-Jun 13 13 STAT1 c-Myc 15 21 12 15 8 USF1 YY1 5 5 5 5 USF1 c-Jun 4 4 5 4 3 YY1 c-Jun 21 15 21 21 5 YY1 c-Myc 5 5 5 5 5 5 5 3 3 3 4 4 4 4 4 4 c-Jun c-Myc 5 5 11 25 7 4 5 28 12 15 4 17 24 ---------------------------------- K562 153 AP-2alpha CTCF 1 1 AP-2alpha GABP 4 4 AP-2alpha JunD 3 3 AP-2alpha Max 8 8 AP-2alpha STAT1 13 13 AP-2alpha c-Fos 3 3 AP-2alpha c-Jun 3 3 AP-2alpha c-Myc 6 6 AP-2gamma CTCF 3 3 2 1 AP-2gamma GABP 4 4 AP-2gamma JunD 3 3 AP-2gamma Max 13 13 AP-2gamma STAT1 0 0 AP-2gamma c-Fos 3 3 3 AP-2gamma c-Jun 3 3 AP-2gamma c-Myc 6 20 6 BHLHE40 FOSL2 20 20 BHLHE40 FOXA1 8 8 7 BHLHE40 FOXA2 7 7 BHLHE40 HNF4A 12 12 BHLHE40 JunD 10 10 BHLHE40 RXRA 4 4 BHLHE40 USF1 0 0 BHLHE40 c-Myc 1 1 CEBPB CTCF 11 18 7 11 8 CEBPB ELF1 14 14 CEBPB ERRA 6 6 CEBPB FOSL2 11 11 CEBPB FOXA1 3 3 2 CEBPB FOXA2 2 2 CEBPB GABP 6 6 CEBPB HNF4A 3 3 3 CEBPB HNF4G 13 13 CEBPB HSF1 2 2 CEBPB JunD 3 3 CEBPB RXRA 26 26 CEBPB SRF 7 7 CEBPB USF1 11 11 CEBPB c-Myc 0 0 0 CTCF EBF 1 2 1 1 CTCF EBF1 1 2 1 1 1 CTCF ELF1 0 30 23 19 22 29 1 0 0 25 32 26 CTCF Egr-1 4 5 4 4 5 0 0 8 4 3 3 CTCF FOSL2 12 12 4 7 1 CTCF FOXA1 62 24 23 41 40 62 18 26 25 CTCF FOXA2 11 23 5 11 3 CTCF GABP 15 2 5 13 15 CTCF HNF4A 14 6 19 32 18 11 14 26 13 CTCF HNF4G 11 6 36 11 35 CTCF JunB 11 16 11 9 CTCF JunD 13 13 8 16 12 2 3 19 1 10 0 9 5 CTCF MEF2A 12 12 4 11 CTCF Max 2 7 11 2 3 9 2 CTCF NRSF 3 1 4 24 24 3 3 6 3 7 CTCF PAX5 11 11 10 7 CTCF POU2F2 2 2 2 10 CTCF PU.1 14 14 32 16 28 37 34 CTCF RXRA 3 3 4 2 15 2 3 CTCF SRF 13 25 24 13 17 5 4 0 10 1 CTCF STAT1 2 4 28 27 2 43 2 CTCF TCF12 3 3 1 2 CTCF USF1 8 7 21 17 8 27 7 8 42 18 CTCF YY1 8 7 8 8 4 6 6 6 4 2 8 7 11 7 CTCF ZEB1 5 5 0 4 CTCF c-Fos 11 1 11 9 CTCF c-Jun 9 3 4 9 CTCF c-Myc 1 2 1 0 2 1 0 4 1 1 7 15 0 16 30 30 26 24 27 10 13 19 1 13 EBF ELF1 8 8 EBF ETS1 5 5 EBF Egr-1 1 1 EBF JunD 8 8 EBF MEF2A 2 2 EBF MEF2C 23 23 EBF Max 12 12 EBF NFKB 4 4 4 EBF PAX5 0 0 EBF POU2F2 10 10 EBF PU.1 5 5 EBF SRF 2 2 EBF TCF12 1 1 EBF ZEB1 3 3 EBF c-Jun 7 7 EBF c-Myc 21 21 EBF1 ELF1 10 10 EBF1 ETS1 5 5 EBF1 Egr-1 0 0 EBF1 JunD 2 2 EBF1 MEF2A 16 16 EBF1 MEF2C 10 10 EBF1 Max 14 14 EBF1 NFKB 4 4 4 EBF1 PAX5 7 7 EBF1 POU2F2 10 10 EBF1 PU.1 5 5 EBF1 SRF 8 8 EBF1 TCF12 16 16 EBF1 ZEB1 43 43 EBF1 c-Jun 23 23 EBF1 c-Myc 21 21 ELF1 ETS1 2 2 2 ELF1 Egr-1 8 4 4 8 8 ELF1 FOS 5 5 5 ELF1 FOSL1 5 5 ELF1 FOSL2 5 5 ELF1 FOXA1 15 15 4 ELF1 FOXA2 4 4 ELF1 GABP 3 2 3 1 ELF1 GATA1 30 30 ELF1 GATA2 30 13 30 19 ELF1 HNF4A 0 0 0 ELF1 HNF4G 0 0 ELF1 HSF1 1 1 ELF1 JunB 4 4 ELF1 JunD 7 7 6 ELF1 MEF2A 15 15 ELF1 Max 13 13 ELF1 NFKB 4 3 4 ELF1 NRSF 12 12 ELF1 PAX5 6 6 ELF1 POU2F2 8 8 ELF1 PU.1 2 2 0 ELF1 RXRA 3 3 ELF1 SRF 10 6 5 10 ELF1 STAT1 4 4 4 3 ELF1 TCF12 2 2 ELF1 USF1 9 12 9 9 ELF1 YY1 5 2 5 ELF1 ZEB1 4 4 ELF1 c-Jun 6 5 6 5 6 ELF1 c-Myc 28 19 25 16 36 22 34 28 ERRA FOXA1 3 3 2 ERRA FOXA2 2 2 ERRA HNF4A 4 3 4 ERRA HNF4G 9 9 ERRA JunD 10 10 ERRA RXRA 0 0 ERRA USF1 5 5 ETS1 Egr-1 2 2 ETS1 MEF2A 8 8 ETS1 MEF2C 14 14 ETS1 Max 34 34 ETS1 NFKB 9 9 2 ETS1 PAX5 10 10 ETS1 POU2F2 15 15 ETS1 PU.1 0 0 ETS1 SRF 17 17 ETS1 TCF12 16 16 ETS1 USF1 33 33 ETS1 ZEB1 14 14 ETS1 c-Jun 5 5 Egr-1 FOS 37 37 Egr-1 FOSL1 37 37 Egr-1 GABP 9 9 5 Egr-1 GATA1 14 14 Egr-1 GATA2 14 14 16 20 Egr-1 JunB 36 36 Egr-1 JunD 25 25 2 38 Egr-1 MEF2A 10 10 Egr-1 MEF2C 38 38 Egr-1 Max 4 0 4 3 Egr-1 NFKB 9 9 9 Egr-1 NRSF 11 11 Egr-1 PAX5 6 0 6 Egr-1 POU2F2 13 13 Egr-1 PU.1 2 2 2 Egr-1 SRF 13 4 13 Egr-1 TCF12 3 3 Egr-1 USF1 2 2 3 2 Egr-1 YY1 13 5 13 78 Egr-1 ZEB1 1 1 Egr-1 c-Jun 37 37 37 15 36 Egr-1 c-Myc 2 2 2 3 2 2 3 2 2 FOS GABP 31 31 FOS GATA1 12 12 FOS GATA2 21 21 20 21 FOS Max 3 3 FOS NF-E2 2 2 FOS NRSF 8 8 FOS PU.1 5 5 FOS USF1 4 4 FOS YY1 13 7 13 FOS c-Myc 5 5 5 4 4 FOSL1 GABP 5 5 5 FOSL1 GATA1 21 21 FOSL1 GATA2 14 12 14 25 FOSL1 Max 3 3 FOSL1 NF-E2 2 2 FOSL1 NRSF 11 11 FOSL1 PU.1 5 5 FOSL1 SRF 4 4 FOSL1 USF1 4 4 FOSL1 YY1 7 7 7 FOSL1 c-Myc 5 5 5 5 4 FOSL2 FOXA1 4 4 3 4 FOSL2 FOXA2 3 3 FOSL2 GABP 19 19 FOSL2 HNF4A 20 1 20 FOSL2 HNF4G 6 6 FOSL2 HSF1 2 2 FOSL2 RXRA 9 9 FOSL2 SRF 0 0 FOSL2 USF1 6 6 FOSL2 c-Myc 5 5 FOXA1 HNF4A 5 5 5 4 4 FOXA1 HNF4G 5 5 4 FOXA1 HSF1 12 18 12 FOXA1 JunD 4 4 3 FOXA1 RXRA 3 3 2 FOXA1 SRF 2 1 2 FOXA1 USF1 13 12 13 FOXA1 c-Myc 6 5 6 FOXA2 GABP 2 2 2 FOXA2 HNF4A 4 4 4 FOXA2 HNF4G 4 4 FOXA2 JunD 3 3 FOXA2 RXRA 2 2 FOXA2 SRF 2 2 FOXA2 USF1 12 12 FOXA2 c-Myc 6 6 GABP GATA1 15 6 15 GABP GATA2 8 8 5 20 GABP HNF4A 30 30 30 GABP HNF4G 6 6 GABP JunB 17 17 GABP JunD 5 5 5 5 4 GABP Max 12 12 0 GABP NRSF 4 4 1 GABP PAX5 3 3 GABP PU.1 1 1 1 GABP SRF 15 12 6 15 GABP STAT1 5 4 5 GABP TCF12 2 2 GABP USF1 14 14 14 GABP YY1 6 6 3 GABP c-Fos 9 9 GABP c-Jun 6 9 5 6 6 0 GABP c-Myc 15 12 15 16 14 13 11 4 GATA1 JunB 16 16 GATA1 JunD 15 15 GATA1 Max 24 24 GATA1 NRSF 1 1 GATA1 PU.1 11 11 GATA1 USF1 19 19 GATA1 YY1 17 17 GATA1 c-Jun 26 26 16 GATA1 c-Myc 13 11 25 13 12 GATA2 JunB 13 16 13 11 18 GATA2 JunD 24 20 24 22 GATA2 Max 28 28 11 24 GATA2 NRSF 5 5 17 1 GATA2 PU.1 11 22 18 11 GATA2 STAT1 56 56 55 GATA2 USF1 14 14 26 11 GATA2 YY1 24 24 16 4 9 5 GATA2 c-Jun 16 11 14 17 10 21 20 19 16 12 12 16 16 GATA2 c-Myc 13 16 12 11 16 12 11 14 13 59 13 13 16 13 12 HNF4A HSF1 5 3 5 HNF4A JunD 11 11 10 HNF4A RXRA 3 3 3 HNF4A SRF 9 9 9 HNF4A USF1 26 8 26 HNF4A c-Myc 7 7 7 HNF4G HSF1 8 8 8 HNF4G JunD 5 5 HNF4G RXRA 3 3 HNF4G SRF 6 6 HNF4G USF1 7 7 HNF4G c-Myc 7 7 HSF1 JunD 7 7 7 JunB Max 2 2 JunB NF-E2 3 3 JunB NRSF 16 16 JunB PU.1 6 6 JunB SRF 15 15 JunB STAT1 14 14 JunB USF1 3 3 JunB YY1 6 5 6 JunB c-Myc 4 4 4 2 3 3 JunD MEF2A 13 13 JunD MEF2C 14 14 JunD Max 6 6 6 34 4 34 JunD NF-E2 1 1 JunD NFKB 12 20 12 JunD NRSF 7 12 7 7 7 3 JunD PAX5 4 4 JunD POU2F2 16 16 JunD POU5F1 20 20 JunD PU.1 6 20 6 JunD RXRA 15 15 7 JunD SRF 9 3 9 5 0 JunD STAT1 12 10 12 11 JunD TCF12 12 12 JunD USF1 6 6 4 5 JunD YY1 12 6 3 12 JunD c-Myc 6 3 6 6 6 6 7 4 5 MEF2A NFKB 11 11 11 MEF2A PAX5 13 13 MEF2A POU2F2 1 1 MEF2A PU.1 8 8 MEF2A SRF 0 0 MEF2A TCF12 7 7 MEF2A ZEB1 2 2 MEF2A c-Jun 12 12 MEF2C NFKB 14 11 14 18 MEF2C PAX5 7 7 MEF2C POU2F2 12 12 MEF2C PU.1 8 8 MEF2C SRF 0 0 MEF2C TCF12 6 6 MEF2C c-Jun 13 13 Max NF-E2 5 4 5 5 Max NRSF 1 1 9 1 Max Nrf1 0 0 0 Max PAX5 0 0 Max POU2F2 17 17 Max PU.1 35 35 Max SRF 9 9 Max STAT1 10 6 10 Max TCF12 44 44 Max YY1 3 2 2 2 3 3 3 Max c-Fos 3 3 Max c-Jun 3 3 3 8 3 4 3 2 NF-E2 PU.1 37 37 NF-E2 USF1 6 6 NF-E2 YY1 11 11 NF-E2 c-Jun 3 2 3 2 3 NF-E2 c-Myc 7 7 6 NFKB PAX5 19 19 35 NFKB POU2F2 15 1 15 NFKB PU.1 2 2 2 NFKB SRF 26 26 9 NFKB TCF12 8 8 8 NFKB c-Jun 14 6 14 NFKB c-Myc 14 14 NRSF PAX5 4 4 4 NRSF PU.1 19 19 19 NRSF SRF 17 17 NRSF STAT1 2 2 NRSF TCF12 5 5 NRSF USF1 6 6 NRSF YY1 4 4 4 10 3 NRSF c-Fos 2 2 NRSF c-Jun 22 12 11 22 10 22 NRSF c-Myc 6 23 0 6 10 12 6 Nrf1 c-Myc 5 0 5 PAX5 POU2F2 4 4 4 PAX5 PU.1 14 14 PAX5 SRF 11 11 PAX5 TCF12 4 4 PAX5 USF1 1 1 PAX5 ZEB1 19 19 PAX5 c-Jun 3 3 PAX5 c-Myc 3 2 3 POU2F2 PU.1 17 17 17 POU2F2 SRF 20 20 POU2F2 TCF12 10 10 POU2F2 ZEB1 0 0 POU2F2 c-Jun 15 15 POU2F2 c-Myc 7 7 5 POU5F1 YY1 12 12 PU.1 SRF 47 47 7 47 10 10 PU.1 TCF12 25 25 PU.1 USF1 34 34 PU.1 YY1 33 33 PU.1 c-Jun 5 5 5 6 5 6 PU.1 c-Myc 26 26 16 RXRA SRF 5 5 RXRA USF1 5 5 5 RXRA YY1 7 7 RXRA c-Myc 5 5 SRF STAT1 33 33 33 34 33 SRF TCF12 7 7 1 SRF USF1 12 0 4 12 1 SRF YY1 47 47 7 28 47 SRF ZEB1 8 8 SRF c-Jun 1 1 1 SRF c-Myc 15 20 26 15 32 STAT1 YY1 61 61 STAT1 c-Fos 23 23 STAT1 c-Jun 13 9 13 STAT1 c-Myc 15 0 19 21 12 15 8 TCF12 ZEB1 2 2 TCF12 c-Jun 6 6 TCF12 c-Myc 10 10 USF1 YY1 5 4 4 5 5 5 USF1 c-Jun 4 4 5 4 3 YY1 c-Jun 21 15 21 21 5 YY1 c-Myc 5 5 5 5 5 5 5 3 3 3 4 4 4 4 4 4 c-Fos c-Myc 15 6 15 c-Jun c-Myc 15 6 15 3 6 5 11 25 7 4 5 28 12 15 4 17 24 ---------------------------------- All cell type 390